The collaborative research centre 533 studies dynamic processes in biopolymers, in particular conformational changes in proteins, on a time-scale of femtoseconds to seconds. These processes are crucial to their function, their folding, and intra- as well as inter-molecular interactions. They include relaxations after perturbations, as well as fluctuations around their equilibria. The collaborative research centre 533 focuses in its work on perturbations by light, because they provide unique access to the fastest time-scales. In contrast to the well-known static structures on many proteins, we are just beginning to understand their dynamic structures and, likewise is the computational treatment very limited. Progress during the second funding period terminating in 2002, is based equally on advances in biochemical preparation, in spectroscopic techniques and in computational treatment. We have improved our general understanding of protein dynamics as well as detailed their functions in the selected systems, thereby strenghtening the concept of the collaborative research centre.
DFG Programme
Collaborative Research Centres
International Connection
Israel
Completed projects
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A01 - Biliproteine: Photochemie und Faltung
(Project Head
Scheer, Hugo
)
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A2 - Strukturelle Flexibilität von Phycobiliprotein-Komplexen
(Project Heads
Huber, Robert
;
Reuter, Wolfgang
)
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A03 - Untersuchung der Molekularen Dynamik und Struktur von Phycoerythrocyanin (PEC) und des Grün-Fluoreszierenden Proteins (GFP) mittels Kernresonanz-Spektroskopie und Kristallographie
(Project Head
Holak, Tadeusz
)
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A4 - Dynamik der halobakteriellen Retinalproteine
(Project Head
Oesterhelt, Dieter
)
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A05 - Lichtabhängige Dynamik von Flavoproteinen
(Project Heads
Bacher, Adelbert
;
Eisenreich, Wolfgang
;
Fischer, Markus
)
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A06 - Chlorophyll-Proteine und -Peptide
(Project Heads
Scheer, Hugo
;
Scherz, Avigdor
)
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A7 - Dynamik des Chromophors und des Proteins bei der Lichtreaktion der NADPH: Protochlorophyllid-Oxidoreduktase
(Project Heads
Oster, Ulrike
;
Rüdiger, Wolfhart
)
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A8 - Lichtinduzierte Konformationsübergänge in Modellpeptiden
(Project Heads
Moroder, Luis
;
Renner, Christian
)
-
A9 - Bestimmung der Faltungsbarrieren in Bakteriorhodopsin und Annexin V mittels Einzelmolekül Kraftspektroskopie
(Project Head
Gaub, Hermann E.
)
-
A10 - Phytochrom
(Project Head
Gärtner, Wolfgang
)
-
A11 - Untersuchung der lichtinduzierten Reorganisationsvorgänge im "Green Fluorescent Protein" (GFP) durch Mutagenese
(Project Head
Steipe, Boris
)
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A12 - Neue Klassen und Varianten des GFPs
(Project Head
Budisa, Nediljko
)
-
A13 - De-novo-Bakteriochlorophyll-Proteine als Modell-Systeme für Licht-induzierte Proteindynamik
(Project Head
Braun, Paula
)
-
A14 - Photoinduzierbare Bindungen von Zelladhäsionsrezeptoren an peptidfunktionaliesierte Oberflächen
(Project Heads
Ehmoser, Eva-Kathrin
;
Oesterhelt, Dieter
)
-
A15 - Lichtinduzierte Dynamik von Protein und Chromophor in der Bindungsstelle gezielt veränderter Lipocalinproteine (Anticaline)
(Project Heads
Bach, Thorsten
;
Michel-Beyerle, Maria Elisabeth
;
Skerra, Ph.D., Arne
)
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B01 - Ultrakurzzeitspektroskopie von lichtinduzierten Strukturänderungen an Chromoproteinen
(Project Heads
Braun, Markus
;
Zinth, Wolfgang
)
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B02 - Lichtinduzierte Dynamik in Chromophor/Protein-Systemen
(Project Heads
Bach, Thorsten
;
Michel-Beyerle, Maria Elisabeth
;
Skerra, Ph.D., Arne
)
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B3 - Kraftmikroskopische Untersuchungen der Struktur und Dynamik nativer Retinalproteine im Millisekundenbereich
(Project Head
Fritz, Monika
)
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B4 - Photoinduzierte Konformationsrelaxationen in Proteinen
(Project Head
Parak, Fritz G.
)
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B05 - Lokale Elektrostatik in Proteinen: Stark-Effekt-Experimente und Molekulardynamik-Simulationen
(Project Heads
Friedrich, Josef
;
Scharnagl, Christina
)
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B6 - Konformations- und Faltungsdynamik in Proteinen und Peptiden
(Project Heads
Michel-Beyerle, Maria Elisabeth
;
Ogrodnik, Alexander
)
-
B07 - Einzelmolekülspektroskopische Untersuchung von Protein-Chromophor-Wechselwirkung
(Project Head
Bräuchle, Christoph
)
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B8 - Ultrakurzzeitspektroskopie von lichtinduzierten Strukturänderungen an Peptid-Modellsystemen
(Project Heads
Wachtveitl, Josef
;
Zinth, Wolfgang
)
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B09 - Zeitaufgelöste Spektroskopie von Azobenzol-Peptid-Modellsystemen - Parametervariation für den quantitativen Vergleich von Experiment und Simulation
(Project Head
Zinth, Wolfgang
)
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B10 - Zeitaufgelöste Röntgenstrukturanalyse
(Project Head
Schmidt, Marius
)
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B11 - Proteindynamik unter Hochdruck
(Project Head
Doster, Wolfgang
)
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C01 - Theorie und Computersimulation der Konformationsdynamik von lichtschaltbaren Peptiden in natürlicher Umgebung
(Project Head
Tavan, Paul
)
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C02 - Proteinspezifische Wechselwirkungsmechanismen bei lichtinduzierten Relaxationsprozessen
(Project Heads
Fischer, Sighart F.
;
Scharnagl, Christina
)
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C03 - Quantenmechanische Beschreibung der Spektren und Kraftfelder von Proteinbausteinen und Chromophoren in situ
(Project Head
Tavan, Paul
)
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G - Zentrale Aufgaben des Sonderforschungsbereichs
(Project Head
Scheer, Hugo
)
