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gene expression analyser

Subject Area Microbiology, Virology and Immunology
Term Funded in 2009
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 135066428
 
Final Report Year 2013

Final Report Abstract

Der lllumina iScan wurde in der Abteilung Genomics & lmmunoregulation am LIMES-Institut der Universität Bonn für die Durchführung von Transkriptom-Analysen beschafft und verwendet. Die Arbeitsgruppe Genomics & lmmunoregulation (Leitung Prof. Dr. Joachim L. Schultze) verwendet das Gerät für eigene Projekte im Rahmen der Charakterisierung von humanen und murinen T -Zell Populationen und zur Charakterisierung von myeloiden Zellpopulationen mit einem Schwerpunkt auf Makrophagen. Im Rahmen mehrerer Forschungsverbünde wie dem SFB 704 "Molekulare Mechanismen und chemische Modulation der lokalen lmmunregulation", dem SFB 645 "Regulation and manipulation of information flow within dynamic protein and Iipid environments", dem SFB 832 .Molecular basis and modulation of cellular interactions in the tumour microenvironment", dem Exzellenzcluster lmmunoSensation-the immune sensory system, sowie den EU Projekten Marie Curie Initial Training Network: Tumour lnfiltrating Myeloid Cell Compartment (TIMCC) und euriPFnet - wird das Gerät zur Durchführung von Kooperationen im Bereich Transkriptom-Analyse benutzt. Darüber hinaus wurden in Kooperationsprojekten mit lokalen, nationalen und internationalen Partnern Projekte durchgeführt. Hierbei fungiert die Abteilung Genomics & lmmunoregulation nicht im Sinne einer Core Facility sondern immer als Kooperationspartner. Neben der eigentlichen experimentellen Analytik mit Hilfe des lllumina iScan wird in diesen Kooperationen auch die bioinformatische Analytik durch die Abteilung Genomics & lmmunoregulation durchgeführt

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