Genetic variants associated with melanoma susceptibility and overall survival

• Applicant: Professor Dr. Dirk Schadendorf
• Subject Area: Dermatology
• Term: from 2010 to 2013
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 161980124

Vor kurzem gelang es einzelne Pigmentierungs-assoziierte Gene als genetische Faktoren zuidentifizieren, die das Risiko an einem sporadischen Melanom zu erkranken, modulieren.Weitere genetische Faktoren, die entweder das Erkrankungsrisiko mitbeeinflussen odergenetische Faktoren, die den Krankheitsverlauf maßgeblich beeinflussen, sind größtenteilsunbekannt. Wir beabsichtigen daher mit einer genomweiten Assoziationsstudie folgende Zielezu erreichen und nachfolgende Faktoren zu identifizieren: 1) genetischen Varianten, die dasRisiko, an einem sporadischen Melanom zu erkranken, modulieren und II) die genetischenLoci, die den klinischen Krankheitsverlauf beeinflussen - insbesondere das Gesamtüberleben- zu identifizieren. In der ersten Projektphase werden wir DNA von 1000 Melanompatientenmit bekanntem klinischen Verlauf mittels DNA-SNP-Mikroarrays untersuchen und mit Datender Gesundheitskontrolle der Deutschen NGFN-Initiative, Popgen, vergleichen. DasVorhandensein klinischer (Verlaufs-)Informationen ist von kritischer Bedeutung. Dies erlaubteine Auswahl und Unterteilung der Fälle in 2 gleichgroße Gruppen: a) Patienten, die innerhalbvon 5 Jahren nach Diagnose des Primärtumors verstorben sind; und b) die, die mindestens 5Jahre überlebt haben. Der Vergleich wird dienlich sein, die genetischen Loci, die mit demGesamtüberleben verknüpft sind, zu identifizieren. Die zweite Projektphase ist dieValidatierungsphase, in der die Marker mit den höchsten Signalen aus der ersten Stufe (bis zuca. 1000 Markern, die aufgrund ihrer P-Werte ausgewählt werden) in einer Gruppe vonweiteren ca. 3000 Kontrollen und Melanompatienten überprüft werden. Das beantragteProjekt ist international ohne derzeitige Konkurrenz und wird genetische Loci identifizieren, die sowohl das Erkrankungsrisiko als auch den Krankheitsverlauf modulieren.

• DFG Programme: Research Grants
• Participating Persons: Professor Dr. Kari Hemminki, Ph.D.; Professor Dr. Rajiv Kumar