Friction in Protein and Peptide Dynamics (A06)

• Subject Area: Biophysics
• Term: from 2010 to 2013
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 111166240

Ein Verständnis der Struktur und Dynamik entfalteter und partiell gefalteter Zustände von Proteinen ist wesentlich, will man die Energielandschaft von Proteinfaltungsvorgängen verstehen. Wir werden eine Kombination von Fluoreszenz-Energie-Transfer (FRET) und Triplett-Triplett Transfer (TTET) Experimenten einsetzen, um die räumliche Ausdehnung, sowie die intra-Ketten-Diffusionskonstanten von Modellpeptiden, entfalteten Proteinen und Faltungsintermediaten aufzuklären. Diese Experimente werden uns effektive Reibungskoeffizienten für die interne Kettendynamik liefern, die uns wiederum eine Berechnung der Reibungskräfte aufgrund von Kettenbewegungen in mechanischen Faltungs-/Enfaltungsexperimenten erlauben.

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 863: Forces in Biomolecular Systems
• Major Instrumentation: Picoseconds Fluorescence Lifetime Instrument Picoquant
• Instrumentation Group: 5230 Densitometer, Mikrophotometer, Fluoreszenz-, Lumineszenz-Imagingsysteme
• Applicant Institution: Technische Universität München (TUM)
• Project Head: Professor Dr. Thomas Kiefhaber