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Kartenbasierte und Funktionsorientierte genomische Ansätze zur Analyse der Vererbung und Ausprägung von Merkmalen des Wasserbindungsvermögens in kommerziellen Schweinepopulationen
Antragsteller
Professor Dr. Tosso Leeb; Professor Dr. Klaus Wimmers
Fachliche Zuordnung
Tierzucht, Tierernährung, Tierhaltung
Förderung
Förderung von 2009 bis 2014
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 168151505
In diesem Projekt möchten wir die ursächlichen Gene für die beobachtete Variation im Tropfsaftverlust bei kommerziellen Schweinepopulationen identifizieren. Einerseits werden wir die Analyse von Kandidatengenen fortsetzen, die während der ersten Förderperiode der Forschergruppe identifiziert wurden. Andererseits werden wir aber auch mit modernsten experimentellen Strategien, die erst in den letzten zwei Jahren verfügbar geworden sind, nach neuen Kandidatengenen für Tropfsaftverlust suchen. Dazu möchten wir die Expression aller Transkripte einschließlich nicht-kodierender RNAs in ausgewählten genomischen Regionen der QTL-Intervalle mit Hilfe von sogenannten Tiling Microarrays quantifizieren. Hierbei werden wir insbesondere nach Unterschieden im Expressionsmuster zwischen Merkmals-divergenten und QTLGenotyp-divergenten Schweinen suchen. Weiterhin möchten wir mit Hilfe einer genomweiten Assoziationsstudie direkt in kommerziellen Schweinepopulationen nach kausalen Genorten für Tropfsaftverlust suchen. Ausgewählte Kandidatengene sollen näher charakterisiert werden, um Marker für die Zucht auf bessere Fleischqualität und idealer weise auch die ursächlichen Mutationen selbst identifizieren zu können.
DFG-Verfahren
Sachbeihilfen
Internationaler Bezug
Schweiz