UHPLC-gekoppeltes Q-TOF-Massenspektrometer
Final Report Abstract
Die Fakultät für Biologie, Biozentrum Würzburg, hat eine zentrale Metabolom-Analytik-Plattform unter der Federführung des Lehrstuhls Pharm. Biologie etabliert. Neben einem Teil der Investitionsmittel für das bewilligte UPLC-Q-TOF Massenspektrometer, dem zentralen Gerät der Metabolomics-Plattform, stellte die Fakultät zwei Dauerstellen (Akad. Rat a. L. und TA) für den dauerhaften Betrieb bereit. Weitere Grundausstattung an Geräten (UPLC-triple-Q-MS, GC-MS) und Personal wird vom Lehrstuhl Pharm. Biologie gestellt. Die neu bestellte Leiterin der Core Unit, Dr. Fekete, initiierte zwei eigene Forschungsprojekte im SFB1047 TPA4 „Functional impact of clock genes on circadian timing of metabolism – a metabolomics approach“, der Graduiertenschule GSLS „Metabolomic reprogramming required to establish thermotolerance in plants”. Darüber hinaus war sie an dem (ausgelaufenen) SFB567 bzw. ist an der zentralen Analytikplattform des GK1342 (u.a. Etablierung einer Web-basierte Software für das „Lipid Profiling“ (Lipidomics)) beteiligt. Das UPLC-Q-TOF stellt die Basis für diese Projekte dar. Die Bioanalytik-Plattform arbeitet forschungsorientiert und bietet eine Zusammenarbeit in Form von wissenschaftlichen Kooperationen zur Lösung komplexer Fragestellungen an (vorwiegend differentiellen ungerichtete Metaboliteanalysen, Metabolit-Strukturaufklärung, Lipid-Profiling und Target-Metabolite Analyse). Das UPLC-Q-TOF-Gerät wird für spezielle Fragestellungen aus allen Bereichen der Lebenswissenschaften bis hin zu einer Systembeschreibung und der bioinformatorische Modellierung metabolischer Netzwerke eingesetzt. In geringen Ausmaß werden auch reine Service-Messungen durchgeführt (vorwiegend Target-Metabolit Analysen und Strukturaufklärung von Fraktionen), für die Standardprozeduren bereits entwickelt wurden. Seit 2011 wurden insgesamt 28 Projekte mit 26 Kooperationspartnern aus den Fakultäten Biologie, Medizin, Chemie und Pharmazie sowie internationalen Kooperationspartnern durchgeführt. Das UPLC-Q-TOF Gerät wird auch in der Lehre für die professionelle Ausbildung von Studierenden der Biologie und Pharmazie im Grund und Hauptstudium sowie von Doktoranden der Lebenswissenschaften eingesetzt. Durch die Einbindung von Studierenden und Doktoranden wird einerseits ein professionelles Training des wissenschaftlichen Nachwuchses (Entwicklung analytischer Methoden, Bearbeitung analytischer Fragestellungen) erreicht und andererseits eine relativ hohe Zahl von Kooperationsprojekten ermöglicht. Eine Übersicht über die Tätigkeit der Einrichtung und des Einsatzes des bewilligten Gerätes ist auf der Metabolomics-Homepage zu finden: http://www.metabolomics.biozentrum.uni-wuerzburg.de/
Publications
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