Gaschromatograph mit Flugzeit-Massenspektrometer
Final Report Abstract
Das GCMS System wurde zur Messung von Profilen nicht phosphorylierter Metabolite im hohen Durchsatz angeschafft. Hierzu zählen insbesondere Aminosäuren, Zucker und organische Säuren. Wir nutzen die Ergebnisse dieser Messungen für eine Reihe biologischer Fragestellungen: Im Rahmen der Forschergruppe „Photorespiration: Origins and Metabolic Integration in Interacting Compartments“ analysieren wir den Einfluss der mitochondrialen Atmungskette auf die Photorespiration. Hierbei liefern Metabolitprofile sowohl Informationen über die Photorespirationsrate als auch über die Aktivität des Citratzyklus. Hierbei können auch schwere Isotope von Kohlenstoff eingesetzt werden, die eine direkte Quantifizierung des Stofffluss erlauben. Wir haben inzwischen die Markierungs- und Nachweismethodik in unserem Labor optimiert. Darüber hinaus ist die Messmethodik zu einem integralen Bestandteil kooperativer Analysen innerhalb des Graduiertenkollegs „Signaling at the Plant-Soil Interface“ geworden. Wir nutzen die Profile insbesondere zur Bestimmung von Zuckerkonzentrationen und Stoffflüssen in und aus Zuckerpools in Abhängigkeit der Infektion von Pflanzen mit Mykorrhiza-Pilzen. Diese Methode stellt für mehrere Arbeitsgruppen des Graduiertenkollegs eine wichtige Ressource dar. Hiermit assoziiert sind Projekte zur Erforschung der Stressresistenz von Nutzpflanzen, bei denen wir unter Stress induzierte Metabolite bestimmen. Hierneben ist das GCMS-System eine wichtige Komponente der Ausbildung von MSc-Studierenden im massenspektrometrischen Techniken und der Analyse sehr großer Datensätze. Die Arbeit mit dem System ist auch ein wichtiger Bestandteil von Weiterbildungsangeboten im Rahmen der Postgraduierten-Ausbildung.
