Structure function relationships in the archaeal transcription machinery (A03)

• Subject Area: Biochemistry
• Term: from 2011 to 2015
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 185476941

Das vollständig rekombinante Transkriptionssystem des Archaeons Pyrococcus furiosus wird als Modell zur Analyse von Struktur-Funktionsbeziehungen in der RNA Polymerase herangezogen. Im Einzelnen werden folgende Fragestellungen bearbeitet: Die Rolle der trigger-loop der RNA Polymerase beim Einbau von Nukleotiden im aktiven Zentrum des Enzyms; die Rolle und Lokalisation von TFE im Initiations- und Elongationskomplex, sowie die Interaktion von TFE mit dem E´-F –Subkomplex der RNA Polymerase. Die Funktion von TFB, insbesondere beim Übergang, Initiation zur Elongation. Außerdem wird die Interaktion von wildtypischen und mutierten archaeellen RNAP –Untereinheiten mit eukaryotischen RNA Polymerasen analysiert.

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 960: Ribosome Formation: Principles of RNP Biogenesis and Control of their Function
• Applicant Institution: Universität Regensburg
• Project Head: Professor Dr. Michael Thomm