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Quadrupol-Flugzeit-Massenspektrometer mit nano-HPLC

Subject Area Basic Research in Biology and Medicine
Term Funded in 2011
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 204119356
 
Final Report Year 2015

Final Report Abstract

Das Q-TOF-Massenspektrometer mit nano-UPLC wird in der Proteinanalytik eingesetzt und dient zur Unterstützung der Projekte der Arbeitsgruppen des Institutes für Biochemie und einiger benachbarter Institute. Im Vordergrund des Einsatzes des Massenspektrometers stehen die Charakterisierung rekombinanter Proteine, deren Sequenzbestätigung, der Nachweis von Modifikationen, Mutationen und Disulfidbrücken. In kleineren Proteomics-Projekten wurden Proteine aus verschiedenen Organismen identifiziert. Ein Focus der Arbeiten liegt auf der genauen Charakterisierung und Sequenzierung von Proteinen für Röntgenkristallstrukturanalysen und NMR-Untersuchungen, von Enzymvarianten, die für die chemische Proteinsynthese genutzt werden, sowie von humantherapeutisch relevanten Proteinen. Antikörper-Fragmente wurden de novo sequenziert. Ein weiteres wichtiges Aufgabengebiet ist die Identifizierung und Quantifizierung von Protein-Modifikationen, wie z.B. Glycosylierungen, Myrestoylierungen, Phosphorylierungen, Methylierungen von Argininen, Acetylierungen und Succinylierungen von Lysinen.

Publications

  • High level expression of the Drosophila Toll receptor ectodomain and crystallization of its complex with the morphogen Spätzle. Biological Chemistry Aug.2013, 394(8),1091-6
    Stelter M., Fandrich U.,Franzke K., Schierhorn A., Breithaupt C.,Parthier C.,Stubbs M.T.
  • Identification of Drosophila and Human 7-Methyl GMP-specific Nucleotidases. Journal of Biological Chemistry 2013, 288(4)2441-51
    Buschmann J., Moritz B., Jeske M., Lilie H., Schierhorn A., Wahle E.
  • Intestinal roteins associated with vitamin D receptor deficiency: a proteomic analysis. Lipids Health Dis.2014 Mar.19 ,13:51
    Kühne H., Schutkwski A., Weinholz S., Cordes C., Schierhorn A., Lichtenfels R., König B., Stangl G.I.
    (See online at https://doi.org/10.1186/1476-511X-13-51)
 
 

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