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Molecular Mechanisms of Viral Resistance and Susceptibility in Ostreococcus tauri

Applicant Dr. Jessica Kegel
Subject Area Organismic Interactions, Chemical Ecology and Microbiomes of Plant Systems
Term from 2012 to 2014
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 220278428
 
Im mikrobiellen Kreislauf spielen marine Viren eine entscheidende Rolle. Sie regulieren die mikrobielle Mortalität, Produktion, Lebensgemeinschaftsaufbau und dadurch den globalen biogeochemischen Zyklus. Durch Transduktion unterstützen Viren den genetischen Ausstausch zwischen Mikroben und beeinflussen dadurch die genetische Diversität der mikrobiellen Lebensgemeinschaft. Marine Viren kontrollieren auch Algenblüten und formen die Evolution von Phytoplanktondiversität. Trotzdem sind die Faktoren die Resistenz und Anfälligkeit des Wirtes beherrschen kaum bekannt und erforscht.Das Ziel dieses Projekts ist es die Rolle von Wirtsgenen in Ostreococcus tauri in Bezug auf Virus-Resistenz und -Anfälligkeit zu untersuchen.Ostreococcus tauri und dessen Viren bieten ein Modelsystem für viele marine Wirt-Virus Interaktionen welche schwer für Analysen zugängig sind. Sowohl vom Wirt als auch von dessen Virus sind die Genome komplett charakterisiert und ein funktionierendes Transformationssystem von O. tauri wurde etabliert. Die Kombination von Genomik mit Expressionsdaten und Durchflusszytometrie ist ein neuer Ansatz um Wirt-Virus Interaktionen von marinen Protisten zu untersuchen. Interessante Gene wurden bereits identifiziert und Transformation wird eingesetzt um deren Expression zu erhöhen bzw. zu erniedrigen. Die resultierenden resistenten oder anfälligen Phenotypen werden mittels mikrobiologischen und molekularbiologischen Techniken sowie Durchflusszytometrie untersucht. Eigenschaften wie Genexpression, Latenzzeit, Ausbruchszeit und Wirtsspezifität werden bestimmt. Die Bestimmung von Genen die in der Virus-Resistenz und -Anfälligkeit der Grünalge O. tauri involviert sind, wird dabei helfen grundlegende Virus-Resistenz von Phytoplankton besser zu verstehen.
DFG Programme Research Fellowships
International Connection France
 
 

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