RNA-Analyse-System
Final Report Abstract
Das Gerät hat uns erlaubt als weltweit erste Gruppe die Technologie für die molekulare Diagnostik und Subtypisierung von aggressiven reifzelligen B-Zell-Lymphomen anzuwenden. Wir haben dazu die Expression ausgewählter Gene formalinfixiertem und Paraffin-eingebettetem Material untersucht. Das in der Zeitrschrift „Blood“ publizierte Verfahren wird von anderen Arbeitsgruppen bereits angewendet mit denen wir in Kontakt stehen. Begleitet wurden die Studien in enger Kooperation mit der Universität Regensburg, Institut für funktionelle Genomik (Prof. Spang) durch technische Entwicklungen, wie zum Beispiel ein neues Verfahren zur Normaliserung von Daten der Genexpression. Die Technik ein wesentlicher Bestandteil weiterer Forschungsprojekte und erfolgreicher Drittmittelanträge.
Publications
- Molecular classification of mature aggressive B-cell lymphoma using digital multiplexed gene expression on formalin-fixed paraffin-embedded biopsy specimens. Blood. 2013 Sep 12;122(11):1985-6
Masqué-Soler N, Szczepanowski M, Kohler CW, Spang R, Klapper W
(See online at https://doi.org/10.1182/blood-2013-06-508937) - Clinical and pathological features of Burkitt lymphoma showing expression of BCL2--an analysis including gene expression in formalin-fixed paraffinembedded tissue. Br J Haematol. 2015 Nov;171(4):501-8
Masqué-Soler N, Szczepanowski M, Kohler CW, Aukema SM, Nagel I, Richter J, Siebert R, Spang R, Burkhardt B, Klapper W
(See online at https://doi.org/10.1111/bjh.13624) - Reference point insensitive molecular data analysis. Bioinformatics. 2016 Sep 15. pii: btw598
Altenbuchinger M, Rehberg T, Zacharias HU, Stämmler F, Dettmer K, Weber D, Hiergeist A, Gessner A, Holler E, Oefner PJ, Spang R
(See online at https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw598)
