Flüssigkeitschromatographie-gekoppeltes Elektrospray-Ionisations-Massenspektrometer
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Das Massenspektrometer wurde für die Zentrale Serviceeinheit Proteomanalyse der Universitätsmedizin Göttingen (UMG) beschafft und stützt seit der Inbetriebnahme Ende 2012 die Forschungsinfrastruktur des Hauses. Als erstem Massenspektrometer der Serviceeinheit kommt dem System dabei eine zentrale Bedeutung zu. Das System wird von einer Vielzahl forschender Gruppen der UMG Routine Analysen verwendet, insbesondere zur Proteinidentifizierung, zur Analyse von Affinitätsaufreinigungen (AP-MS) und zur globalen Proteomanalyse entweder nach Isotopenmarkierung durch das sog. SILAC-Verfahren oder oder durch serielle Messungen ohne Isotopenlabel (sog. Labelfreie Analysen). Das Instrument wird in den unten aufgelisteten Drittmittelprojekten verwendet; insbesondere in dem SFB1190 (Compartmental Gates and Contact Sites within Cells) kommt dem Instrument mit den genannten Arbeitsabläufen eine zentrale Bedeutung zu, da es innerhalb des Z02 Projektes Massenspektrometrische Proteomanalyse stark frequentiert wird. Innerhalb des SFB 1190 wurde ein Techniker eingestellt, der für die Proteomanalysen zuständig ist und damit auch für das hier beschriebene Massenspektrometer.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
- The SUMO1- E67 Interacting Loop Peptide Is an Allosteric Inhibitor of the Dipeptidyl Peptidases 8 and 9. J Biol Chem 288, 32787-32796 (2013)
Pilla E, Kilisch M, Lenz C, et al.
(Siehe online unter https://doi.org/10.1074/jbc.M113.489179) - Quantitative mass spectrometric profiling of cancer-cell proteomes derived from liquid and solid tumors. Journal of Visualized Experiments, 96:e52435. (2015)
Bohnenberger, H., Strobel, P., Mohr, S., et al.
(Siehe online unter https://doi.org/10.3791/52435) - ‚A deep proteomics perspective on CRM1-mediated nuclear export and nucleocytoplasmic partitioning.’ Elife. 4, pii: e11466 (2015)
Kırlı K, Karaca S, Dehne HJ et al.
(Siehe online unter https://doi.org/10.7554/eLife.11466) - DPP9 is a novel component of the N-end rule pathway targeting the tyrosine kinase Syk. eLife. 5. pii: e16370 (2016)
Justa-Schuch D, Silva-Garcia M, Pilla E, Engelke M, et al.
(Siehe online unter https://doi.org/10.7554/eLife.16370.001) - Elucidation of tonic and activated B-cell receptor signaling in Burkitt's lymphoma provides insights into regulation of cell survival. Proc Natl Acad Sci USA. 113(20):5688-93 (2016)
Corso J, Pan KT, Walter R, et al.
(Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1601053113) - Hair cell synaptic dysfunction, auditory fatigue and thermal sensitivity in otoferlin Ile515Thr mutants. EMBO J. 35, 2519-2535 (2016)
Strenzke N, Chakrabarti R, Al-Moyed H et al.
(Siehe online unter https://doi.org/10.15252/embj.201694564) - The adaptor protein CIN85 assembles intracellular signaling clusters for B cell activation. Sci Signal. 9(434):ra66 (2016)
Kühn J, Wong LE, Pirkuliyeva S, et al.
(Siehe online unter https://doi.org/10.1126/scisignal.aad6275) - ‚Calpainmediated cleavage of collapsing response mediator protein-2 drives acute axonal degeneration.’ Sci Rep. 6, 37050 (2016)
Zhang JN, Michel U, Lenz C et al.
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/srep37050) - ‚TIM29 is a subunit of the human carrier translocase required for protein transport.’ FEBS Lett. 590, 4147-4158 (2016)
Callegari S, Richter F, Chojnacka K et al.
(Siehe online unter https://doi.org/10.1002/1873-3468.12450) - ‚Hypoxiastimulated membrane trafficking requires T-plastin’, Acta Physiol (Oxf). (2017) Feb 20
Wottawa M, Naas S, Böttger J. et al.
(Siehe online unter https://doi.org/10.1111/apha.12859)
