Konformationskontrolle von Multidomänenproteinen durch RNA Bindung (B03)

• Fachliche Zuordnung: Strukturbiologie
• Förderung: Förderung von 2012 bis 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 201302640

Strukturelle Mechanismen und die Dynamik von Multidomänproteinkomplexen in frühen Stadien der Assemblierung des Spleißosoms werden untersucht. Ausgehend von unseren jüngsten Ergebnissen werden wir konformationelle Änderungen bei der Erkennung der 3’ Spleißstellen RNA (durch U2AF2/1, hnRNP A1 und SF1), die Wechselwirkung dieser Faktoren mit U1 snRNP an der 5' Spleißstelle durch Überbrückungsfaktoren im "E Komplex", sowie den Proteinkomplex, der die Erkennung von neuronalen Mikroexons vermittelt, untersuchen. Integrierte Strukturbiologie in Lösung, moderne NMR Verfahren, SAXS/SANS und FRET Experimente werden mit Röntgenstrukturanalyse und Kryo-EM kombiniert. Die Rolle von RNA Sequenzvariationen, konformationellen Gleichgewichten, intrinsisch ungeordneten Bereichen, sowie von Krankheit-assoziierten Mutationen in den Spleißfaktoren werden charakterisiert. Die Ergebnisse werden aufzeigen, wie die konformationelle Regulation und Dynamik von Multidomänenproteinkomplexen die RNA Erkennung und Regulation des prä-mRNA Spleißens bei der Assemblierung des Spleißosoms beeinflussen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1035: Kontrolle von Proteinfunktion durch konformationelles Schalten
• Antragstellende Institution: Technische Universität München (TUM)
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Michael Sattler