Interaction structures with host cells and molecular phylogenetic studies of the Dothideomycetes with particular emphasis on (hemi-)biotrophic plant parasites
Final Report Abstract
Durch Anwenden eines besonderen Reinigungsprotokolls sowie Verwenden des GenomiPhi-Kits gelang es erstmals für die große und wirtschaftlich bedeutende Familie der Mycosphaerellaceae, Sequenzen (kernkodierte ribosomale DNA) eines biotrophen Pilzes (Cymadothea trifolii) zu gewinnen. Auch ein weiteres, allerdings nekrotrophes Mitglied der Mycosphaerellaceae, M. podagrariae, konnte erstmals phylogenetisch eingeordnet sowie elektronenmikroskopisch beschrieben werden. Beides geschah in enger Zusammenarbeit mit P. Crous und E. Groenewald (Utrecht). Im Verlauf der Kooperation mit der Gruppe um T. Rouxel (Versailles) gelang es, zwei Mutanten des wichtigen Rapspathogens Leptosphaeria maculans zu charakterisieren, wobei der Antragsteller zusammen mit einer studentischen Hilfskraft die elektronenmikroskopischen Untersuchungen übernahm. Diese Ergebnisse können dabei helfen, den Infektionsverlauf der Rapsumfallkrankheit zu verstehen und möglicherweise Ansätze zu deren Bekämpfung liefern. Durch umfangreiche Klonierungsarbeiten konnten wir erstmals für filamentöse Pilze zeigen, dass die kernkodierte ribosomale DNA weitaus heterogener ist als gemeinhin angenommen. Es stellte sich heraus, dass die Kopien ribosomaler Gene innerhalb eines einzigen Organismus keinesfalls so homogen sind wie erwartet wurde und sich einzelne Loci (z.B. SSU vs. LSU) z. T. deutlich in ihrem Polymorphismusmuster unterscheiden. Weiterhin fanden wir, dass die gleichen Genabschnitte bei verschiedenen Arten deutliche Unterschiede in Anzahl und Typ der Polymorphismen aufwiesen. In all den genannten Bereichen konnten hochkarätige Publikationen erzielt werden.
Publications
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(2007). Evolutionstheorie contra Schöpfungslehre - ein alter Streit kommt an die Unis. Biologie in unserer Zeit 37 (1), 16-17
Simon UK
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(2008). Intragenomic variation of fungal ribosomal genes is higher than previously thought. Molecular Biology and Evolution 25 (11): 2251–2254
Simon UK, Weiß M
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(2008). The Lmgpi15 gene, encoding a component of the glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis pathway, is required for morphogenesis and pathogenicity in Leptosphaeria maculans. New Phytologist 179 (4), 1105-1120
Remy E, Meyer M, Blaise F, Simon UK, Kuhn D, Chabirand M, Riquelme M, Balesdent M-H, Rouxel T
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(2009). Cymadothea trifolii, an obligate biotrophic leaf parasite of Trifolium, belongs to Mycosphaerellaceae as shown by nuclear ribosomal DNA analyses. Persoonia 22: 49-55
Simon UK, Groenewald JZ, Crous P
