Thermodynamic modelling of transcriptional regulation: improving input data and exploring cis-element architecture (A16*)

• Subject Area: Developmental Biology
• Term: from 2013 to 2016
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5486242

Trotz langjähriger Forschung ist unser Verständnis der räumlich-zeitlichen Transkriptionsregulation während der Organismen-Entwicklung unvollständig. Auf Grundlage eines thermodynamischen Models der Drosophila-Segmentierung möchte dieses Projekt vorhandene Unklarheiten durch experimentelle und rechenbasierte Ansätze lösen. Durch direkte Bestimmung der Bindungsaffinitäten von beteiligten Transkriptionsfaktoren und systematischer Untersuchung der Regeln von cis-Elementen soll das Modell verbessert und erweitert werden, um Expressionsmuster genauer vorhersagen zu können.

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 646: Networks in Genome Expression and Maintenance
• Applicant Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Project Head: Professorin Dr. Ulrike Gaul (†)