Funktionen langer nicht-kodierender RNAs in gesunder und neoplastischer Epidermis

• Antragsteller: Dr. Markus Kretz
• Fachliche Zuordnung: Dermatologie ; Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung ; Zellbiologie
• Förderung: Förderung von 2013 bis 2015
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 242285656

Das hier beantragte Forschungsprojekt untersucht die Funktionen langer nicht-kodierender RNAs (lncRNAs) in gesunder und neoplastischer Haut.Das humane Genom kodiert für tausende von langen, nicht Protein-kodierenden Transkripten mit einer Länge von mehr als 200nt. Obwohl eine wachsende Zahl von Studien zeigt, dass lncRNAs wichtige Funktionen in einer Vielzahl biologischer Prozesse haben, ist deren Rolle beim Übergang von gesundem zu neoplastischem, menschlichen Gewebe während der Krebs-Entwicklung weitestgehend ungeklärt. In diesem Projekt wird die Funktion von 6 Hautkrebs-assoziierten lncRNAs in neoplastischer, organotypischer Epidermis analysiert. All diese lncRNAs wurden anhand von zuvor durchgeführten RNA-Sequenzierungs-Studien ausgewählt und zeigen reduziertes Vorkommen in Gewebe von Hautkrebs-Patienten (Plattenepithelkarzinom), bei gleichzeitig erhöhter Expression in differenzierten Zellen. Dieses dynamische Expressionsmuster weist auf eine Doppelrolle der ausgewählten lncRNAs bei der epidermalen Differenzierung, sowie der Plattenepithelkarzinom-Entwicklung hin. Die funktionelle Analyse dieser lnRNAs erfolgt anhand von zwei spezifischen Zielen:Ziel 1: Funktionelle Analyse der Plattenepithelkarzinom-assoziierten lncRNAs in der Differenzierung humaner Epidermis. Wir werden zu diesem Zweck lncRNA-defizientes Gewebe mittels RNA-Interferenz herstellen und auf Veränderungen des Differenzierungsprozesses hin untersuchen. Im zweiten Teil des beantragten Projekts erfolgt die funktionelle Analyse Plattenepithelkarzinom-assoziierter lncRNAs in neoplastischem Gewebe. LncRNAs mit funktioneller Relevanz im epidermalen Differenzierungs-Prozess (getestet in Ziel 1) werden zu diesem Zwecke in neoplastischer, humaner Epidermis kontinuierlich exprimiert und deren Einfluss auf Tumorzell-Wachstum und Invasionsrate getestet. Die Charakterisierung Hautkrebs-assoziierter, langer nicht-kodierender RNAs wird uns einen besseren Einblick in die Funktionen und Mechanismen dieser lncRNAs in gesundem und neoplastischem, humanen Gewebe geben und führt eventuell zur Identifizierung von neuen Zielmolekülen zur Diagnose und/oder Behandlung von Haut-Krankheiten sowie Haut-Krebs.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen