Quantitative Kartierung synaptischer Proteine und mRNA in Neuronen & eine nano-analytische Plattform zum Messen der Bindungsmechanismen RNA-bindender Proteine (A08)

• Fachliche Zuordnung: Biophysik
• Förderung: Förderung von 2014 bis 2023
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 161793742

Die synaptische Aktivität ist an Protein-Kopienzahlen gekoppelt, welche variieren und durch das Vorhandensein von mRNA und miRNA reguliert werden. Wir werden eine nanoskalige Bildgebungsplattform entwickeln, die eine umfassende Analyse von Protein, mRNA und microRNA (das "localizome") ermöglicht, indem wir mehrere Proteine und mRNA-Spezies in derselben Zelle unter Verwendung von Einzelmolekül-Hochauflösungsmikroskopie visualisieren. Neben der Lokalisierung und Quantifizierung von Protein und mRNA wollen wir Werkzeuge entwickeln, die eine Superauflösung von Molekülen, die miRNA/mRNA regulieren, und neu transkribierten Proteinen ermöglichen. Darüber hinaus werden wir eine nano-analytische Plattform entwickeln, um den Mechanismus der Bindung von RNA-bindenden Proteinen an ihre Ziel-RNA-Sequenz zu untersuchen. Diese neuartige Plattform wird es ermöglichen, unveränderte Proteine zu untersuchen und Informationen über Bindungsgleichgewichte und -kinetik, Sequenzspezifität, Interaktion mit Co-Faktoren und den Einfluss von Mutationen zu liefern.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 902: Molekulare Mechanismen der RNA-basierten Regulation
• Antragstellende Institution: Goethe-Universität Frankfurt am Main
• Mitantragstellende Institution: Max-Planck-Institut für Hirnforschung
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Mike Heilemann