Next generation sequencing and bioinformatics platform (Z04*)

• Subject Area: Medicine
• Term: from 2014 to 2017
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 75732319

Die wesentlichen Ziele dieses Projektes sind: (1) Die Bereitstellung einer wet-lab Plattform um NGS durchzuführen, speziell konzipiert für RNA- und Chip-Seq Analysen, zur Anwendung in der vaskulären Forschung. (2) Die Entwicklung von bioinformatischen Programmen zur Auswertung von Hochdurchsatz-Sequenzdaten und weiterführende Analysen von vaskulären Gennetzwerken. Um diese Ziele zu erreichen, werden wir einen Service für Hochdurchsatz-Sequenzierung anbieten und bei der Auswertung der entstehenden Daten, sowie Microarraydaten, Unterstützung leisten. Außerdem werden wir Algorithmen bzw. Programme entwickeln, um zusätzliche biologische Erkenntnisse aus NGS Daten zu gewinnen.

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 834: Endothelial Signalling and Vascular Repair
• Applicant Institution: Goethe-Universität Frankfurt am Main
• Project Head: Professor Dr. Shizuka Uchida, Ph.D.