Characterization of nitrite oxidizing bacteria with 13C-labeling experiments in complex ecosystems

• Applicant: Professor Dr. André Lipski
• Subject Area: Microbial Ecology and Applied Microbiology
• Term: from 2006 to 2012
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 25821765

Im beantragten Projekt sollen neue Arten der Gattung Nitrospira selektiv angereichert, isoliert und physiologisch charakterisiert werden. Vorläufige Untersuchungen haben gezeigt, dass diese Nitritoxidanten bislang unbekannte physiologische Eigenschaften wie Nitrifikation bei extremen Temperaturen oder sauren pH-Werten aufweisen, die auf eine zentrale ökologische Bedeutung dieser Gattung in verschiedenen extremen Habitaten hinweisen. Als Basis liegen bereits zahlreiche Anreicherungskulturen von Nitrospira vor, die größtenteils aus extremen Lebensräumen gewonnen wurden. Für die neuen Nitrospira-Kulturen sollen chemotaxonomische Merkmale erhoben werden, die sowohl für eine Differenzierung als auch für einen Direktnachweis in komplexen Mischproben genutzt werden. Dieser soll mit Hilfe einer isotopengestützten Markierungstechnik auch Informationen über die Aktivität dieser Organismen ermöglichen. Ziel des geplanten Projektes ist es, den bisher nahezu ausschließlich über klonierte 16S rDNA Sequenzen definierten Stammbaum von Nitrospira mit phänotypischen Daten zu belegen, um ihre physiologische Funktion für biogeochemische Kreisläufe nachzuweisen.

• DFG Programme: Research Grants