MALDI-TOF/TOF-Massenspektrometer mit Matrixsprayer
Final Report Abstract
Das eingeworbene FTICR Massenspektrometer wurde einerseits für das Forschungsgebiet MALDI MS lmaglng eingesetzt. Die molekulare Zusammensetzung von Gewebeschnitten von relevanten Tiermodellen oder auch humanen Resekttatproben wurde ortsaufgelöst vermessen. Mit Hilfe dieser Technik konnten so unter anderem die endogene Protease-Aktivität in Magentumoren und der Einfluss von Umweltfaktoren auf die Bildung von amyloidogenen AB Peptiden analysiert werden. Weiterhin wurde die Verteilung von zahlreichen Wirkstoffen, Metaboliten und Lipiden untersucht. Auch quantitative Verteilungsstudien wurden durchgeführt und zum Beispielzur Quantifizierung von lmatinib in humanen Resektaten von GIST Krebspatienten eingesetzt. Weiterhin wurde das FTICR MS für die multimodale Analfiik von verschiedenen Tumoren und der Niemann-Pick Erkrankung vom Typ C in Mausmodellen genutzt. ln alldiesen Studien war die sehr hohe Massengenauigkeit des lnstruments ausschlaggebend für die Erreichung der Forschungsziele, da nur so die Signalvalidierung oder Signalidentifizierung der endogenen und exogenen Analyten möglich war. Parallel zum Hauptanalyten können zahlreiche weitere Moleküle mitgescannt werden wodurch auch die Detektion von pharmakodynamischen Markern oder die ldentifizierung von unbekannten (diagnostischen) Biomarkern ermöglicht wird. Auch im Bereich der MALDI Assays wurde das Massenspektrometer erfolgreich zur Signalvalidierung eingesetzt. Massenüberlagerungen im zellbasierten lnhibitor Screen konnten so ausgeschlossen werden.
Publications
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Alzheimer’s-Causing Mutations Shift Aβ Length by Destabilizing γ-Secretase-Aβn Interactions. Cell, 170(3), 443-456.e14.
Szaruga, Maria; Munteanu, Bogdan; Lismont, Sam; Veugelen, Sarah; Horré, Katrien; Mercken, Marc; Saido, Takaomi C.; Ryan, Natalie S.; De Vos, Tatjana; Savvides, Savvas N.; Gallardo, Rodrigo; Schymkowitz, Joost; Rousseau, Frederic; Fox, Nick C.; Hopf, Carsten; De Strooper, Bart & Chávez-Gutiérrez, Lucía
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Automated analysis of lipid drug-response markers by combined fast and high-resolution whole cell MALDI mass spectrometry biotyping. Scientific Reports, 8(1).
Weigt, David; Sammour, Denis A.; Ulrich, Timon; Munteanu, Bogdan & Hopf, Carsten
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Fourier Transform Infrared Microscopy Enables Guidance of Automated Mass Spectrometry Imaging to Predefined Tissue Morphologies. Scientific Reports, 8(1).
Rabe, Jan-Hinrich; A. Sammour, Denis; Schulz, Sandra; Munteanu, Bogdan; Ott, Martina; Ochs, Katharina; Hohenberger, Peter; Marx, Alexander; Platten, Michael; Opitz, Christiane A.; Ory, Daniel S. & Hopf, Carsten
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The combination of 2,5-dihydroxybenzoic acid and 2,5-dihydroxyacetophenone matrices for unequivocal assignment of phosphatidylethanolamine species in complex mixtures. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 410(9), 2437-2447.
Schröter, Jenny; Fülöp, Annabelle; Hopf, Carsten & Schiller, Jürgen
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Mechanistic MALDI-TOF Cell-Based Assay for the Discovery of Potent and Specific Fatty Acid Synthase Inhibitors. Cell Chemical Biology, 26(9), 1322-1331.e4.
Weigt, David; Parrish, Cynthia A.; Krueger, Julie A.; Oleykowski, Catherine A.; Rendina, Alan R. & Hopf, Carsten
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METASPACE: A community-populated knowledge base of spatial metabolomes in health and disease. openRxiv.
Alexandrov, Theodore; Ovchinnikova, Katja; Palmer, Andrew; Kovalev, Vitaly; Tarasov, Artem; Stuart, Lachlan; Nigmetzianov, Renat; Fay, Dominik; Gaudin, Mathieu; Lopez, Cristina Gonzalez; Vetter, Marina; Swales, John; Bokhart, Mark; Kompauer, Mario; McKenzie, James; Rappez, Luca; Velickovic, Dusan; Lavigne, Regis; Zhang, Guanshi ... & Shahidi-Latham, Sheerin
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Quantitative Mass Spectrometry Imaging Reveals Mutation Status-independent Lack of Imatinib in Liver Metastases of Gastrointestinal Stromal Tumors. Scientific Reports, 9(1).
Abu Sammour, Denis; Marsching, Christian; Geisel, Alexander; Erich, Katrin; Schulz, Sandra; Ramallo Guevara, Carina; Rabe, Jan-Hinrich; Marx, Alexander; Findeisen, Peter; Hohenberger, Peter & Hopf, Carsten
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Spatial Distribution of Endogenous Tissue Protease Activity in Gastric Carcinoma Mapped by MALDI Mass Spectrometry Imaging. Molecular & Cellular Proteomics, 18(1), 151-161.
Erich, Katrin; Reinle, Kevin; Müller, Torsten; Munteanu, Bogdan; Sammour, Denis A.; Hinsenkamp, Isabel; Gutting, Tobias; Burgermeister, Elke; Findeisen, Peter; Ebert, Matthias P.; Krijgsveld, Jeroen & Hopf, Carsten
