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Chemical tools for the elucidation of the role of the acid sphingomyelinase under physiological or pathological conditions

Subject Area Biological and Biomimetic Chemistry
Organic Molecular Chemistry - Synthesis and Characterisation
Term from 2014 to 2022
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 266895703
 
Final Report Year 2022

Final Report Abstract

Die saure Sphingomyelinase ist ein Enzym mit unterschiedlichsten Rollen unter normalen physiologischen Bedingungen aber auch im Zusammenhang mit verschiedenen Krankheiten. Das Enzym ist normalerweise in den Lysosomen am konstitutiven Abbau der Plasmamembran beteiligt, kann aber auch als Reaktion auf verschiedene Stimuli sezerniert werden. Eine starke Sezernierung des Enzyms wurde vor allem in akut entzündlichen Krankheiten wie dem akuten Lungenversagen (ALI) oder bei Sepsis beschrieben. Eine Hemmung des Enzyms wurde auch als experimentelle Therapie für die schwere Depression (Major Depression) oder für eine Infektion mit SARS-Cov2 beschrieben. Daneben existiert aber auch eine angeborene Defizienz der sauren Sphingomyelinase, die als Niemann-Pick Krankheit der Typen A und B bekannt ist. Die vielschichtige Rolle des Enzyms verlangt nach Werkzeugen um die verschiedenen Wirkmechanismen mit hoher Genauigkeit, d.h. orts- und zeitaufgelöst untersuchen zu können. Da solche Werkzeuge bisher nicht existierten, sind viele Fragen auf dem Gebiet offengeblieben. Wir haben im Verlauf der Projektförderung verschiedene FRET Sonden entwickelt, die es erstmals erlauben, das Enzym in lebenden Zellen direkt bei der Katalyse zu beobachten. Diese Sonden konnten auch für eine bequeme Messung der sezernierten Sphingomyelinase herangezogen werden. Wir haben zellpermeable Inhibitoren hergestellt, die lichtgesteuert aktiviert werden können, um perspektivisch die saure Sphingomyelinase in Geweben orts- und zeitaufgelöst zu inhibieren. Darüber hinaus haben wir etablierte Zelllinien genetisch modifiziert und so bereits erste Zellen erhalten, die als geeignetes Modell für die Niemann-Pick Krankheit mit ihren verschiedenen Genotypen fungieren können. In Kombination mit den FRET Sonden, die die Aktivität des Enzyms innerhalb der Zelle abbilden soll nun eine wirkmächtige Entwickelt werden, mit denen nach Verbindungen gesucht werden kann, die die saure Sphingomyelinase Defizienz in Patienten abmildern und deren Lebensqualität verbessern können. Es wurden bereits erste vielversprechende Kandidaten identifiziert, die das Potenzial dieser Herangehensweise eindrucksvoll unterstreichen.

Publications

  • "Five-, four- and three-dentate europium chelates for anion sensing and their applicability to enzymatic dephosphorylation reactions" Chemistry Select 2018, 3, 12430-12439
    Z. H. Mohamed, T. Soukka, C. Arenz, M. Schäferling
    (See online at https://doi.org/10.1002/slct.201803287)
  • "FRET probes for measuring sphingolipid metabolizing enzyme activity (Review)" Chem. Phys. Lipids 2018, 216,152-161
    Z. H. Mohamed, C. Rhein, E. M. Saied, J. Kornhuber, C. Arenz
    (See online at https://doi.org/10.1016/j.chemphyslip.2018.09.014)
  • "Optical Nanosensing of Lipid Accumulation due to Enzyme Inhibition in Live Cells" ACS Nano. 2019, 13, 9363-9375
    V. Živanovic, Seifert, Drescher, P. Schrade, S. Werner, P. Guttmann, G. P. Szekeres, S. Bachmann, G. Schneider, C. Arenz, J. Kneipp
    (See online at https://doi.org/10.1021/acsnano.9b04001)
  • "A novel visible range FRET probe for monitoring acid sphingomyelinase activity in living cells" Chemistry – Eur J 2020, 26, 5780-5783
    C. Kappe, Z. H. Mohamed, E. Naser, A. Carpinteiro, C. Arenz
    (See online at https://doi.org/10.1002/chem.202000133)
  • "Image-based morphological profiling identifies a lysosomotropic, iron-sequestering autophagy inhibitor" Angew. Chem. 2020, 132, 5770-5778
    L. Laraia, G. Garivet, D. J. Foley, N. Kaiser, S. Müller, S. Zinken, T. Pinkert, J. Wilke, D. Corkery, A. Pahl, S. Sievers, P. Janning, C. Arenz, Y. Wu, R. Rodriguez, H. Waldmann
    (See online at https://doi.org/10.1002/anie.201913712)
  • “Characterization of the small molecule ARC39, a direct and specific inhibitor of acid sphingomyelinase in vitro.” J. Lipid Res., 2020
    E. Naser, S. Kadow, F. Schumacher, Z. H. Mohamed, C. Kappe, G. Hessler, B. Pollmeier, B. Kleuser, C. Arenz, K. A. Becker, E. Gulbins, A. Carpinteiro
    (See online at https://doi.org/10.1194/jlr.ra120000682)
  • „A Photocaged Inhibitor of Acid Sphingomyelinase“ Chem. Commun. 2020, 56, 14885 – 14888
    K. Prause, G. Naseri, F. Schumacher, C. Kappe, B. Kleuser and C. Arenz
    (See online at https://doi.org/10.1039/d0cc06661c)
  • "Synthesis and Characterization of a New Two Photon Excitable Acid Sphingomyelinase FRET Probe" Bioorg Med Chem 2021, 44, 116303
    Z. H. Mohamed, C. Rhein, B. Schmid, P. Tripal, J. Kornhuber, C. Arenz
    (See online at https://doi.org/10.1016/j.bmc.2021.116303)
  • “Platelet Extracellular Vesicles mediate Transfusion-related Acute Lung Injury by imbalancing the Sphingolipid Rheostat” Blood 2021, 137, 690–701
    M.J. McVey, S. Weidenfeld, M. Maishan, C. Spring, M. Kim, A. Tabuchi, V. Srbely, A. Takabe-French, S. Simmons, C. Arenz, J. W. Semple and W.M. Kuebler
    (See online at https://doi.org/10.1182/blood.2020005985)
 
 

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