Strukturelle Biochemie des Exosoms in der RNA Prozessierung

• Applicant: Professor Dr. Karl-Peter Hopfner
• Subject Area: Structural Biology
• Term: from 2007 to 2010
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 33197165

Exosomen spielen eine zentrale Rolle in der 3 -Prozessierung und dem Abbau von RNA. Die von uns kürzlich gelöste Kristallstruktur des archaealen Exosoms zeigt, dass das Exosom eine große, aus neun Untereinheiten bestehende Porzessierungs-Kammer ist, die drei aktive Zentren beinhaltet. RNA bindenden Untereinheiten befinden sich an der Aussenseite der Kammer. Basierend auf unseren ersten Ergebnissen möchten wir nun den genauen Mechanismus des Exosomes bei der RNA-Prozessierung und dem RNA-A h bau aufklären. Unser interdisziplinärer Ansatz verbindet Röntgenkristallographie, Röntgenkleinwinkelstreuung (SAXS), Biochemie und, in Kollaboration, chemische Synthese und Hefegenetik. Wir wollen herausfinden, wie RNA Moleküle erkannt und gebunden werden. Wir testen, ob (und wie) RNA in das Exosom nur in einem vollständig entfalteten Zustand eindringen kann. In Kollaboration werden wir unsere Ergebnisse in vivo in Hefe testen. Ein weiteres Ziel wird die Bestimmung der Kristallstruktur einer Helikase der SKI Familie sein, die wichtige Rollen in verschiedensten zellulären Prozessen, einschließlich der Aktivierung des Exosomes, spielen. Die Ergebnisse dieses Antrags sollen ein mechanistisches Konzept für die Biochemie von Exosomen bilden, eine Thema, das zurzeit außergewöhnliches Interesse in der ¿RNA Forschung hervorruft.

• DFG Programme: Research Grants