SPP 2125:  Dekonstruktion und Rekonstruktion der pflanzlichen Mikrobiota "DECRyPT"

• Fachliche Zuordnung: Biologie ; Agrar-, Forstwissenschaften und Tiermedizin ; Medizin
• Förderung: Förderung seit 2018
• Webseite: Zur Homepage
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 360002565

The central scientific objectives of this priority programme (SPP) are to obtain deep and potentially predictive insights into plant-microbiota associations and to develop pioneering reductionist approaches towards a molecular understanding of plant microbiota functions. This SPP will elucidate genetic factors underlying plant microbiota establishment, test presumed community adaptation in ecological contexts and define community-associated emergent properties. Computational and genomic tools will guide hypothesis-testing and the design of microbiota reconstitution experiments in controlled environments.

• DFG-Verfahren: Schwerpunktprogramme
• Internationaler Bezug: Niederlande, Schweiz

Projekte

• Accurate and high-resolution classification of synthetic and natural community amplicon data (Antragsteller Garrido-Oter, Ruben )
• Auswirkungen anderer Mikroben und des Wirts auf die Interaktion und ökologische Funktion von Pseudomonas- und Sphingomonas-Isolaten mit Pflanzen (Antragsteller Bossdorf, Oliver ;  Weigel, Ph.D., Detlef )
• Charakterisierung der molekularen Mechanismen lokaler und systemischer Reaktionen in Wurzel-Mikroben Interaktionen mit multiplen Arten (Antragstellerinnen / Antragsteller Tissier, Alain ;  Zuccaro, Alga )
• Charakterisierung der PEROXIDASE 5 als neuen Regulator von Pflanzenwachstum und Immunantworten mittels Mikrobiota-abhängiger, differenzieller Regulation von ROS Homöostase (Antragsteller Schulze-Lefert, Paul )
• Charakterisierung von Mikroben-Mikroben-, Mikroben-Pflanzen- und Pflanzen-Pflanzen-Interaktionen in der Phyllosphäre und deren Einfluss auf die Funktion des Mikrobioms (Antragstellerin Vlot-Schuster, A. Corina )
• Der Einfluss pflanzlicher Sekundärmetaboliten auf die Boden-Microbiota (MICROSEC) (Antragsteller Dörmann, Peter )
• Die Rolle von Basidiomyceten-Hefen in der Entstehung komplexer mikrobieller Netzwerke (Antragsteller Döhlemann, Gunther ;  Kemen, Eric )
• Die Rolle von Camalexin und Schwefelernährung in Mikrobiom Zusammensetzung (Antragsteller Kopriva, Stanislav )
• Eine trockenheitstolerante synthetische Bakteriengemeinschaft für Gerste (Antragsteller Tarkka, Mika )
• Funktionen von T3SS-enthaltenden Proteobakterien und des Immunsystems in der Biogenese der Wurzelmikrobiota (Antragsteller Schulze-Lefert, Paul )
• Genetische Faktoren bei Bakterien die eine Pilz assoziierte Dysbiose in Arabidopsis verhindern (Antragsteller Hacquard, Ph.D., Stephane )
• Genetische Komponenten der bakteriellen Antwort auf pflanzliche Metabolite und die Auswirkungen auf das Pflanzenwachstum (Antragsteller Becker, Claude ;  Schandry, Niklas )
• Identifizierung der Rolle von Knöllchenendophyten bei der Wirksamkeit der Stickstofffixierung (Antragstellerin Marin, Macarena )
• Immunsensoren an der Zelloberfläche überwachen pflanzliche Mikrobiota (Antragstellerin Ranf-Zipproth, Stefanie )
• Konservierung der Immunsuppression durch Xanthomonadales Kommensalen in Arabidopsis Wurzeln (Antragsteller Schulze-Lefert, Paul )
• Koordinationsfonds (Antragstellerin Zuccaro, Alga )
• Mechanismen und Dynamiken der Wirtspräferenz kommensaler, wurzelassoziierter Bakterien (Antragstellerin Wippel, Kathrin )
• -MetaLoMic 2.0- Entschlüsselung des mechanistischen Einflusses von pflanzlichen Sekundärmetaboliten auf die Interaktion von Lotus japonicus mit dem Wurzelmikrobiom (Antragstellerinnen / Antragsteller Dawid, Corinna ;  Gutjahr, Caroline ;  Parniske, Martin ;  Schloter, Michael )
• Molekulare Grundlagen der Interaktion zwischen Mikrobiota und dem pflanzlichen Immunsystem (Antragstellerin Robatzek, Silke )
• Molekulare Grundlagen der Pflanzen Microbiom Funktion und dessen Regulierung durch das Pflanzen Immunsystem (Antragsteller Schulze-Lefert, Paul )
• Molekulare Mechanismen der mikrobiota-beeinflussten Wirts-Wachstums-Abwehr-Koordination (Antragsteller Nakano, Ryohei Thomas )
• Symbiose-abhängige Musterbildung des Wurzelmicrobioms in Lotus japonicus (Antragsteller Ott, Thomas )
• Untersuchung der Interaktionen zwischen Pflanzenimmunität und der Blattmikrobiota auf molekularer Ebene (Antragstellerin Vorholt, Julia )
• Untersuchung des genetischen Zusammenspiels zwischen Arabidopsis Immunität und Mechanismen zur Besiedlung mit Wurzelendophyten (Antragstellerin Parker, Jane E. )
• Ökologie des Kern-Mikrobioms von natürlichen Lotus corniculatus-Populationen (Antragsteller Bossdorf, Oliver ;  Kemen, Eric )

• Sprecherin: Professorin Dr. Alga Zuccaro