Entschlüsselung der Mechano-Regulation des von-Willebrand-Faktors
Biochemie
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Im DFG-Projekt „Entschlüsselung der Mechano-Regulation des Von-Willebrand-Faktors“ haben wir das im Blut zirkulierende Glykoprotein Von-Willebrand-Faktor (VWF) untersucht. Dafür haben wir eine Kombination aus biophysikalischen Einzelmolekültechniken und hochauflösender Strukturanalyse verwendet, um die kraftabhängigen und strukturellen Grundlagen der mechanischen Aktivierung von VWF besser zu verstehen. Wir setzten dabei zwei sich hervorragend ergänzende Kraftspektroskopie- Techniken ein: magnetische Pinzetten, um insbesondere mit sehr kleinen Kräften (< 1 pN) einzuwirken und zu messen, sowie Kraftmikroskopie (AFM), das auch hohe Kräfte im molekularen Maßstab (> 1 nN) leicht ausüben und messen kann. Für beide Methoden entwickelten wir neue Ankopplungsverfahren, die eine stabilere und langlebigere molekulare Bindung zur Manipulation individueller VWF-Moleküle ermöglichen, als die bisher verwendeten Kopplungsstrategien. Mit magnetischen Pinzetten konnten wir zeigen, dass der Stamm des VWF, der aus den 6 C-Domänen besteht und sich wie ein Reißverschluss schließt und sich bei dem im Blut üblichem physiologischem pH-Wert (pH 7,4) schon bei sehr niedrigen Kräften von etwa 1 pN öffnet. In Vorarbeiten untersuchten wir die Rolle von pH-Wert und Mutationen im Stamm des VWF. Außerdem konnten wir mit den magnetischen Pinzetten zeigen, wie Ca²⁺die Faltung der VWF-A2-Domäne stabilisiert, die unter mechanischer Belastung aufklappen kann. Außerdem zeigten wir die Dynamik sowie pH- Abhängigkeiten einer entscheidenden Stelle im Bereich der D'D3-Domänen auf, die offenbar für die Biosynthese von VWF wichtig ist. Mit AFM-Kraftspektroskopie konnten wir VWF-Dimere erstmals unter deutlich höheren Kräften von bis zu > 2 nN untersuchen. Erste Ergebnisse deuten darauf hin, dass möglicherweise Disulfidbrücken im Protein unter so hoher mechanischer Belastung aufbrechen könnten. Darüber hinaus kann auch in inversen VWF-Dimeren die starke D4-Interaktion auftreten, obwohl das inverse Dimer nicht über die CK-Domänen im Stamm verbunden ist. Zudem konnten wir nicht nur die invertierten Dimere sondern auch VWF-Mutanten mit Multimerisierungsdefekten, die zu Blutgerinnungsstörungen des Subtyps 2A der Von-Willebrand-Krankheit führen, mit AFM-Bildern auflösen. Darüber hinaus setzten wir verschiedene biophysikalische Methoden ein, um die VWF-Struktur zu bestimmen. Insbesondere entschlüsselten wir die Strukturen der C4- und C6-Domänen, wodurch wir allgemeine Prinzipien struktureller und funktioneller Eigenschaften der VWF-Stammdomänen ableiten konnten; daraus resultierten drei Publikationen. Zudem charakterisierten wir mit Negative Staining Elektronenmikroskopie strukturell ein VWF-Konstrukt, das den gesamten Bereich von der D4- bis zur C-terminalen CK-Domäne abdeckt. Die inhärente Flexibilität zwischen diesen Domänen hatte bisher eine hochaufgelöste Struktur dieses Konstruktes erschwert. Zusammenfassend hat unser kombinierter Ansatz aus Strukturanalyse und Einzelmolekül- Kraftspektroskopie mehrere wichtige methodische Entwicklungen hervorgebracht, insbesondere die Entwicklung neuer, ultra-stabiler Ankopplungsstrategien sowohl für magnetische Pinzetten als auch für das AFM. Mit diesen Ansätzen konnten wir neue Erkenntnisse über die Wechselwirkungen und die Mechanoregulation mehrerer VWF-Domänen gewinnen. Die Arbeit bietet grundlegende Erkenntnisse zum Verständnis der Aktivierung von nicht nur natürlich vorkommendem VWF, sondern auch für „Gain-of-Function“ Mutanten, die für VWF-Krankheiten von Bedeutung sind. Unser Projekt war stark durch die COVID-Pandemie beeinträchtigt, mit Laborstilllegungen sowie Unterbrechungen der Arbeitsabläufe und der Zusammenarbeit. Überraschende und unermessliche externe Einflüsse überwogen bei weitem die wissenschaftlichen Unwägbarkeiten und unvorhersehbaren Entdeckungen. Dennoch konnten wir eine Reihe spannender Ergebnisse erzielen, die in führenden wissenschaftlichen Fachzeitschriften veröffentlicht wurden, und mehrere vielversprechende Vorarbeiten, die Grundlage für zukünftige Forschungsprojekte sein werden.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
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Biophysical approaches promote advances in the understanding of von Willebrand factor processing and function. Advances in Biological Regulation, 63, 81-91.
Löf, Achim; Müller, Jochen P.; Benoit, Martin & Brehm, Maria A.
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“Structure and dynamics in the von Willebrand factor.” Charles Perkins Centre, University of Sydney, Australia. September 25
Wilmanns, Matthias
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“Willebrand factor gain-of-function mutations with increased risk of myocardial infarction”. Stanford- EMBL Personalized Health Conference, Stanford, USA. Nov 01–03
Wilmanns, Matthias
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Unraveling Mechanoactivation of Von Willebrand Factor by Magnetic Tweezers Force Spectroscopy”, Seminar at the European Molecular Biology Laboratory Hamburg, April 18
Lipfert, Jan
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“Regulation and Dynamics of Biological Macromolecules Under Forces and Torques” Colloquium at the University of Göttingen, November 12
Lipfert, Jan
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“Structure and dynamics in the von Willebrand factor”. CeNS-Colloquium, LMU Munich, Germany. January 12
Wilmanns, Matthias
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Advancing multimer analysis of von Willebrand factor by single-molecule AFM imaging. PLOS ONE, 14(1), e0210963.
Löf, Achim; König, Gesa; Schneppenheim, Sonja; Schneppenheim, Reinhard; Benoit, Martin; Budde, Ulrich; Müller, Jochen P. & Brehm, Maria A.
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Multiplexed protein force spectroscopy reveals equilibrium protein folding dynamics and the low-force response of von Willebrand factor. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(38), 18798-18807.
Löf, Achim; Walker, Philipp U.; Sedlak, Steffen M.; Gruber, Sophia; Obser, Tobias; Brehm, Maria A.; Benoit, Martin & Lipfert, Jan
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Structure and dynamics of the platelet integrin-binding C4 domain of von Willebrand factor. Blood, 133(4), 366-376.
Xu, Emma-Ruoqi; von Bülow, Sören; Chen, Po-Chia; Lenting, Peter J.; Kolšek, Katra; Aponte-Santamaría, Camilo; Simon, Bernd; Foot, Jaelle; Obser, Tobias; Schneppenheim, Reinhard; Gräter, Frauke; Denis, Cécile V.; Wilmanns, Matthias & Hennig, Janosch
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“Interactions, Regulation, and Dynamics of Biological Macromolecules under Forces and Torques”, Colloquium at the University of Jena, December 9
Lipfert, Jan
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“Magnetic Tweezers: New Regimes of Force Spectroscopy” Festkolloquium in Honor of Hermann Gaub, Munich, September 6
Lipfert, Jan
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“Regulation and Dynamics of Biological Macromolecules Under Forces and Torques” Colloquium at King’s College, London, June 25
Lipfert, Jan
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“Regulation and Dynamics of Biological Macromolecules under Forces and Torques” Colloquium at the University of the Saarland, Saarbrücken, November 12
Lipfert, Jan
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“Regulation of the Blood Protein von Willebrand Factor under Low Forces”, Center for NanoScience Retreat, Munich, March 25
Gruber, Sophia
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“Regulation of the Blood Protein von Willebrand Factor under Low Forces”, German-French Biophysics Meeting, Hünfeld, February 16
Gruber, Sophia
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"Interactions, Regulation, and Dynamics of Biological Macromolecules Under Forces and Torques", Colloquium at Utrecht University, March 13
Lipfert, Jan
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Designed anchoring geometries determine lifetimes of biotin–streptavidin bonds under constant load and enable ultra-stable coupling. Nanoscale, 12(41), 21131-21137.
Gruber, Sophia; Löf, Achim; Sedlak, Steffen M.; Benoit, Martin; Gaub, Hermann E. & Lipfert, Jan
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Gain-of-Function Variant p.Pro2555Arg of von Willebrand Factor Increases Aggregate Size through Altering Stem Dynamics. Thrombosis and Haemostasis, 122(02), 226-239.
Huck, Volker; Chen, Po-Chia; Xu, Emma-Ruoqi; Tischer, Alexander; Klemm, Ulrike; Aponte-Santamaría, Camilo; Mess, Christian; Obser, Tobias; Kutzki, Fabian; König, Gesa; Denis, Cécile V.; Gräter, Frauke; Wilmanns, Matthias; Auton, Matthew; Schneider, Stefan W.; Schneppenheim, Reinhard; Hennig, Janosch & Brehm, Maria A.
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“Interactions, Regulation, and Dynamics of Biological Macromolecules Under Forces and Torques”, Colloquium at TU Dresden, June 9
Lipfert, Jan
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“Interactions, Regulation, and Dynamics of Biological Macromolecules Under Forces and Torques”, Colloquium at TU Dresden, June 9
Lipfert, Jan
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“Interactions, Regulation, and Dynamics of Biological Macromolecules Under Forces and Torques”, Colloquium at Utrecht University, March 13
Lipfert, Jan
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“Molecules feel the force - from mechanical properties to mechano-regulation and materials”, Colloquium at Heidelberg University, October 20
Lipfert, Jan
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“Regulation of the Blood Protein von Willebrand Factor under Low Forces”, Single-molecule meeting, Les Houches, France, February 17
Gruber, Sophia
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“Magnetic Tweezers Protein Force Spectroscopy: Applications to Von Willebrand Factor and SARS-CoV-2 Cell Adhesion”, Talk at the DFG Meeting, March 23
Lipfert, Jan
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"Multiplexed Single Molecule Force Spectroscopy of Medically Relevant Proteins with Magnetic Tweezers", PhD thesis
Gruber, Sophia
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A conformational transition of the D′D3 domain primes von Willebrand factor for multimerization. Blood Advances, 6(17), 5198-5209.
Gruber, Sophia; Löf, Achim; Hausch, Adina; Kutzki, Fabian; Jöhr, Res; Obser, Tobias; König, Gesa; Schneppenheim, Reinhard; Aponte-Santamaría, Camilo; Gräter, Frauke; Brehm, Maria A.; Benoit, Martin & Lipfert, Jan
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A tethered ligand assay to probe SARS-CoV-2:ACE2 interactions. Proceedings of the National Academy of Sciences, 119(14).
Bauer, Magnus S.; Gruber, Sophia; Hausch, Adina; Gomes, Priscila S. F. C.; Milles, Lukas F.; Nicolaus, Thomas; Schendel, Leonard C.; Navajas, Pilar López; Procko, Erik; Lietha, Daniel; Melo, Marcelo C. R.; Bernardi, Rafael C.; Gaub, Hermann E. & Lipfert, Jan
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Atomic Force Spectroscopy: High Force Pulling on C- and N-terminal von Willebrand Factor Dimers”, Center for NanoScience Meeting, Venice, Italy, September 19-22
Stubhan, Samuel
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Structure and dynamics of the von Willebrand Factor C6 domain. Journal of Structural Biology, 214(4), 107923.
Chen, Po-chia; Kutzki, Fabian; Mojzisch, Angelika; Simon, Bernd; Xu, Emma-Ruoqi; Aponte-Santamaría, Camilo; Horny, Kai; Jeffries, Cy; Schneppenheim, Reinhard; Wilmanns, Matthias; Brehm, Maria A.; Gräter, Frauke & Hennig, Janosch
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“Interactions, Regulation, and Dynamics of Biological Macromolecules Under Forces and Torques”, Colloquium at Augsburg University, June 29
Lipfert, Jan
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“Interactions, Regulation, and Dynamics of Biological Macromolecules Under Forces and Torques”, Colloquium at the University of Stuttgart, June 27
Lipfert, Jan
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Single-molecule force stability of the SARS-CoV-2–ACE2 interface in variants-of-concern. Nature Nanotechnology, 19(3), 399-405.
Bauer, Magnus S.; Gruber, Sophia; Hausch, Adina; Melo, Marcelo C. R.; Gomes, Priscila S. F. C.; Nicolaus, Thomas; Milles, Lukas F.; Gaub, Hermann E.; Bernardi, Rafael C. & Lipfert, Jan
