OmicsDB – Teilantrag 4 von insgesamt 4 Anträgen

• Subject Area: Biological Chemistry and Food Chemistry
• Term: Funded in 2017
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 389894058

Die Massenspektrometrie erzeugt große Mengen komplexer Daten. Ferner werden zunehmend große Probenzahlen analysiert, um zu statistisch abgesicherten Ergebnissen zu gelangen. Projekte mit tausenden von LC-MS/MS Experimenten, die zu Millionen von identifizierten und quantifizierten Analyten führen sind keine Seltenheit mehr. Damit die dabei im TB Bereich anfallenden Projektdaten umfassend analysiert werden können, ist eine leistungsfähige IT Infrastruktur absolut notwendig. Während derartige Konzepte in der Genomforschung bereits entwickelt sind, trifft dies auf die Proteom- und Metabolomforschung meist nur selten zu. Mit ProteomicsDB haben wir eine einzigartige Datenbank geschaffen, die eine breite und interaktive Analyse proteomischer Daten erlaubt. Kernziele dieses Antrages sind: a) ProteomicsDB physisch an die TU München zu holen damit diese Forschungsinfrastruktur langfristig zu einer OmicsDB weiterentwickelt werden kann; b) die Kapazität zu erhöhen, um die großen hier skizzierten Projekte zu unterstützen und c) die Funktionalität stark zu erweitern. Beispiele hierfür sind die Unterstützung beliebiger Organismen, die Analyse von Protein-Protein bzw. -Wirkstoffinteraktionen, die Integration mit anderen Omics Daten und vieles mehr. OmicsDB ist ein essentieller Bestandteil des Gerätezentrums BayBioMS.

• DFG Programme: Major Research Instrumentation
• Major Instrumentation: OmicsDB – Teilantrag 4 von insgesamt 4 Anträgen
• Instrumentation Group: 7030 Dedizierte, dezentrale Rechenanlagen, Prozeßrechner
• Applicant Institution: Technische Universität München (TUM)
• Leader: Professor Dr. Bernhard Küster