Epigenetische Prägung von Gewebe- und Mikrobiota-abhängigen immunmodulatorischen Eigenschaften in darmdrainierenden Lymphknotenstromazellen

• Antragsteller: Dr. Jörn Pezoldt
• Fachliche Zuordnung: Immunologie ; Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung von 2018 bis 2019
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 397151636

Lymphknoten sind der Knotenpunkt für die Initiierung effektiver adaptiver Immunantworten, angepasst an die jeweiligen drainierten Gewebe (z.B. Lunge, Darm, Haut). Die mesenchymalen Stromazellen des Lymphknoten sind die infrastrukturelle Komponente und tragen zur Ausbildung gewebespezifischen Immunantworten bei. Insbesondere die darmdrainierenden Lymphknoten unterstützen tolerogene Immunantworten und fördern speziell die Induktion von regulatorischen T Zellen.In diesem Projekt möchten wir epigenetischen Modifikationen identifizieren, die ein Gewebe- und Mikrobiota-spezifisches transkriptionelles Funktionsprofil von Lymphknotenstromazellen determinieren. Durch die integrative Analyse von Einzelzell- und Populationstranskriptomen, sowie genomweiter Methylierung von CpG-Motiven und DNA Akzessibilität von verschiedenen Lymphknotenstromazellen sollen folgende Ziele erreicht werden:1) Zuordnen der immunmodulatorischen Funktionen der unterschiedlichen Lymphknotenstromazellen.2) Identifizieren von Gen-zentrischen regulatorischen Netzwerken, welche durch Gewebe-spezifische Einflüsse moduliert werden können.3) Ermitteln von epigenetischen und transkriptionellen Netzwerken die funktionale Eigenschaften der verschiedenen Lymphknoten determinieren.Das bessere Verständnis der regulatorischen Netzwerke, welche die Kapazität von Lymphknotenstromazellen zur Induktion von regulatorischen T Zellen kontrollieren, ermöglicht es das tolerogene Potential von Darm-drainierenden Lymphknote zu heben und somit einen potentiellen Hebel für die Reduzierung von entzündlichen Darmerkrankungen zu identifizieren.

• DFG-Verfahren: Forschungsstipendien
• Internationaler Bezug: Schweiz
• Gastgeber: Professor Dr. Bart Deplancke