Influence of antibiotic treatment on microbiota-dependent Immunoglobuline A production and incidence of ventilator associated infections with Pseudomonas aeruginosa

• Applicant: Dr. Charlotte Thibeault
• Subject Area: Clinical Infectiology and Tropical Medicine
• Term: from 2018 to 2024
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 400667201

• Final Report Year: 2023

Final Report Abstract

Ursprünglich sollte in einer Studie an beatmeten Patient:innen untersucht werden, wie sich Antibiotikatherapien auf das Immunsystem der Lunge und die Bakterien, die normalerweise die Lunge besiedeln (sog. Mikrobiota), auswirkt. Aufgrund der COVID-19-Pandemie kam es zu Verzögerungen der Studie und schlussendlich musste diese leider vorzeitig abgebrochen werden. Stattdessen haben wir eine Übersichtsarbeit publiziert, in der wir die Rolle der Mikrobiota in der Abwehr, aber auch der Entstehung von Lungenentzündungen darstellen. Als sich abzeichnete, dass die Pandemie länger dauern würde, haben wir wie viele Forscher:innen weltweit unsere Ressourcen in die Erforschung insbesondere der Immunantwort auf COVID-19 investiert. Hier haben wir beispielsweise gezeigt, dass Dexamethason, eines der wichtigsten Medikamente in der Therapie der schweren COVID-19-Erkrankung mit immunsuppressiver Wirkung, kurzfristig zu messbar niedrigeren zellulären und Antikörper-Immunantworten führt, den Aufbau eines langfristigen Immungedächtnisses aber nicht zu verhindern scheint.

Publications

• Studying the pathophysiology of coronavirus disease 2019: a protocol for the Berlin prospective COVID-19 patient cohort (Pa-COVID-19). Infection, 48(4), 619-626.
  Kurth, Florian; Roennefarth, Maria; Thibeault, Charlotte; Corman, Victor M.; Müller-Redetzky, Holger; Mittermaier, Mirja; Ruwwe-Glösenkamp, Christoph; Heim, Katrin M.; Krannich, Alexander; Zvorc, Saskia; Schmidt, Sein; Kretzler, Lucie; Dang-Heine, Chantip; Rose, Matthias; Hummel, Michael; Hocke, Andreas; Hübner, Ralf H.; Opitz, Bastian; Mall, Marcus A. ... & Sander, Leif Erik
  
• Clinical and virological characteristics of hospitalised COVID-19 patients in a German tertiary care centre during the first wave of the SARS-CoV-2 pandemic: a prospective observational study. Infection, 49(4), 703-714.
  Thibeault, Charlotte; Mühlemann, Barbara; Helbig, Elisa T.; Mittermaier, Mirja; Lingscheid, Tilman; Tober-Lau, Pinkus; Meyer-Arndt, Lil A.; Meiners, Leonie; Stubbemann, Paula; Haenel, Sascha S.; Bosquillon, de Jarcy Laure; Lippert, Lena; Pfeiffer, Moritz; Stegemann, Miriam S.; Roehle, Robert; Wiebach, Janine; Hippenstiel, Stefan; Zoller, Thomas; Müller-Redetzky, Holger ... & Kurth, Florian
  
• Impact of dexamethasone on SARS-CoV-2 concentration kinetics and antibody response in hospitalized COVID-19 patients: results from a prospective observational study. Clin Microbiol Infect. 2021;27(10):1520 e7- e10.
  Mühlemann B.*, Thibeault C.*, Hillus D.; Helbig ET, Lippert LJ, Tober-Lau P.; Schwarz T.; Müller MA, Witzenrath M.; Suttorp N.; Sander LE, Drosten C. & Jones TC, Corman VM, Kurth F.
  
• The microbiota in pneumonia: From protection to predisposition. Science Translational Medicine, 13(576).
  Thibeault, Charlotte; Suttorp, Norbert & Opitz, Bastian
  
• Complement activation induces excessive T cell cytotoxicity in severe COVID-19. Cell, 185(3), 493-512.e25.
  Georg, Philipp; Astaburuaga-García, Rosario; Bonaguro, Lorenzo; Brumhard, Sophia; Michalick, Laura; Lippert, Lena J.; Kostevc, Tomislav; Gäbel, Christiane; Schneider, Maria; Streitz, Mathias; Demichev, Vadim; Gemünd, Ioanna; Barone, Matthias; Tober-Lau, Pinkus; Helbig, Elisa T.; Hillus, David; Petrov, Lev; Stein, Julia; Dey, Hannah-Philine ... & Sawitzki, Birgit
  
• Early and Rapid Identification of COVID-19 Patients with Neutralizing Type I Interferon Auto-antibodies. Journal of Clinical Immunology, 42(6), 1111-1129.
  Akbil, Bengisu; Meyer, Tim; Stubbemann, Paula; Thibeault, Charlotte; Staudacher, Olga; Niemeyer, Daniela; Jansen, Jenny; Mühlemann, Barbara; Doehn, Jan; Tabeling, Christoph; Nusshag, Christian; Hirzel, Cédric; Sanchez, David Sökler; Nieters, Alexandra; Lother, Achim; Duerschmied, Daniel; Schallner, Nils; Lieberum, Jan Nikolaus; August, Dietrich ... & Goffinet, Christine
  
• Severity of respiratory failure and computed chest tomography in acute COVID-19 correlates with pulmonary function and respiratory symptoms after infection with SARS-CoV-2: An observational longitudinal study over 12 months. Respiratory Medicine, 191, 106709.
  Steinbeis, Fridolin; Thibeault, Charlotte; Doellinger, Felix; Ring, Raphaela Maria; Mittermaier, Mirja; Ruwwe-Glösenkamp, Christoph; Alius, Florian; Knape, Philipp; Meyer, Hans-Jakob; Lippert, Lena Johanna; Helbig, Elisa Theresa; Grund, Daniel; Temmesfeld-Wollbrück, Bettina; Suttorp, Norbert; Sander, Leif Erik; Kurth, Florian; Penzkofer, Tobias; Witzenrath, Martin & Zoller, Thomas
  
• Analysis of acute COVID-19 including chronic morbidity: protocol for the deep phenotyping National Pandemic Cohort Network in Germany (NAPKON-HAP). Infection, 52(1), 93-104.
  Steinbeis, Fridolin; Thibeault, Charlotte; Steinbrecher, Sarah; Ahlgrimm, Yvonne; Haack, Ira an; August, Dietrich; Balzuweit, Beate; Bellinghausen, Carla; Berger, Sarah; Chaplinskaya-Sobol, Irina; Cornely, Oliver; Doeblin, Patrick; Endres, Matthias; Fink, Claudia; Finke, Carsten; Frank, Sandra; Hanß, Sabine; Hartung, Tim; Hellmuth, Johannes Christian ... & Witzenrath, Martin
  
• Cenicriviroc for the treatment of COVID-19: first interim results of a randomised, placebo-controlled, investigator-initiated, double-blind phase II trial. Journal of Global Antimicrobial Resistance, 32, 44-47.
  Kurth, Florian; Helbig, Elisa T.; Lippert, Lena J.; Thibeault, Charlotte; Barbone, Gianluca; Eckart, Marius A.; Kluge, Martin; Puengel, Tobias; Demir, Münevver; Röhle, Robert; Keller, Theresa; Ruwwe-Glösenkamp, Christoph; Witzenrath, Martin; Suttorp, Norbert; von Kalle, Christof; Sander, Leif E.; Jochum, Christoph & Tacke, Frank
  
• Short-and long-term T cell and antibody responses following dexamethasone treatment in COVID-19. JCI Insight, 8(8).
  Thibeault, Charlotte; Bardtke, Lara; Vanshylla, Kanika; di Cristanziano, Veronica; Eberhardt, Kirsten A.; Stubbemann, Paula; Hillus, David; Tober-Lau, Pinkus; Mukherjee, Parnika; Münn, Friederike; Lippert, Lena J.; Helbig, Elisa T.; Lingscheid, Tilman; Steinbeis, Fridolin; Mittermaier, Mirja; Witzenrath, Martin; Zoller, Thomas; Klein, Florian; Sander, Leif E. & Kurth, Florian