Quantification of Gyrification of the Brain

• Applicant: Dr.-Ing. Robert Dahnke
• Subject Area: Cognitive, Systems and Behavioural Neurobiology
• Term: from 2019 to 2021
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 417649423

• Final Report Year: 2021

Final Report Abstract

Die Entwicklung der Faltungsmaße (A1) und Phantome (A2) konnte vollständig umgesetzt werden und sind öffentlich zugänglich. ● Die vorläufigen Vergleiche (A4) verschiedener Faltungsmaße anhand der Phantome zeigen, dass die im Projekt entwickelten Phantome und die Maße gut funktionieren. Die Phantome konnte weiterhin belegen, dass die verschiedenen Faltungsmaße unterschiedliche Eigenschaften erfassen und somit ergänzt genutzt werden können, um detaillierte Aussagen zu erhalten. ● Es hat sich aber auch gezeigt, dass ein bisher nicht genutztes Faltungsmaß deutlich sensitiver als alle anderen Maße (in Humandaten) ist und den hier entwickelten Maßen vorzuziehen ist. ● Die praktische Anwendung der Maße in der Schizophrenie (B1) wurde bisher nicht angegangen. Die Anwendung der Faltungsmaße in Primaten (B2) ist vorbereitet und ein erster Teilschritt, der die Vorverarbeitung von Schimpansen umfasst, wurde publiziert. ● Weiterhin konnten wichtige Aspekte der CAT Software überarbeitet werden, die essentiell für die zukünftigen (klinischen) Nutzung verschiedener Maße ist, wie beispielsweise (i) eine verbesserte Oberflächengenerierung (für genauere und robustere Faltungsmessungen) und (ii) die Verknüpfung mit der veganbagel Software (als weitere Vorstufe zu klinischen Nutzung von CAT und den darin verfügbaren strukturen Maßen), und natürlich (iii) der Faltungsmaße selbst.

Publications

• 2020. Chimpanzee brain morphometry utilizing standardized MRI preprocessing and macroanatomical annotations
  Vickery, S., Hopkins, W.D., Sherwood, C.C., Schapiro, S.J., Latzman, R.D., Caspers, S., Gaser, C., Eickhoff, S.B., Dahnke, R. & Hoffstaedter, F.
  
• 2020. Influence of Processing Pipeline on Cortical Thickness Measurement. Cereb Cortex 30, 5014–5027
  Kharabian Masouleh, S., Eickhoff, S.B., Zeighami, Y., Lewis, L.B., Dahnke, R., Gaser, C., Chouinard-Decorte, F., Lepage, C., Scholtens, L.H., Hoffstaedter, F., Glahn, D.C., Blangero, J., Evans, A.C., Genon, S., Valk, S.L.
  
• Computation Anatomy Toolbox, DGNR Converence 2020, Frankfurt
  Dahnke, R.
  
• New surface pipeline. HBM Conference 2020, Rome
  Dahnke, R., Gaser C.