RNA-binding proteins and control of mRNA metabolism in the regulation of adaptive immunity in humans
Final Report Abstract
In diesem Projekt wurden, ausgehend von Untersuchungen von RNA-Bindeproteinen (RBPs) in der Maus, entsprechende Orthologe des Menschen untersucht. Wir haben in einer globalen Analyse das RBPome, d.h. alle Proteine, die in Maus und Mensch T-Zellen an RNA gebunden vorliegen, bestimmt. Weiterhin wurden in einer vergleichenden Analyse für Maus und Mensch für zwei RBPs in T-Zellen die Bindestellen bestimmt sowie die m6A-modifizierten Basen untersucht. Es wurden neue Antikörper z.B. für die Immunopräzipitation von m6A oder von Pan-Ythdf1/2/3 Proteinen, sowie von Maus und Mensch-erkennenden Antikörpern gegen Arpp21 generiert und/oder validiert. Mit Hilfe dieser Reagenzien und diesen Analysen konnten mehrere Publikationen zusammengestellt werden, die neue Einblicke in die Entwicklung von Thymozyten und die Homöostase und Effektorfunktion von T-Zellen des Menschen und der Maus ermöglichten. Gegenwärtig befinden sich noch weitere Publikationen in Vorbereitung.
Publications
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Defining the RBPome of primary T helper cells to elucidate higher-order Roquin-mediated mRNA regulation. Nature Communications, 12(1).
Hoefig, Kai P.; Reim, Alexander; Gallus, Christian; Wong, Elaine H.; Behrens, Gesine; Conrad, Christine; Xu, Meng; Kifinger, Lisa; Ito-Kureha, Taku; Defourny, Kyra A. Y.; Geerlof, Arie; Mautner, Josef; Hauck, Stefanie M.; Baumjohann, Dirk; Feederle, Regina; Mann, Matthias; Wierer, Michael; Glasmacher, Elke & Heissmeyer, Vigo
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Disrupting Roquin-1 interaction with Regnase-1 induces autoimmunity and enhances antitumor responses. Nature Immunology, 22(12), 1563-1576.
Behrens, Gesine; Edelmann, Stephanie L.; Raj, Timsse; Kronbeck, Nina; Monecke, Thomas; Davydova, Elena; Wong, Elaine H.; Kifinger, Lisa; Giesert, Florian; Kirmaier, Martin E.; Hohn, Christine; de Jonge, Laura S.; Pisfil, Mariano Gonzalez; Fu, Mingui; Theurich, Sebastian; Feske, Stefan; Kawakami, Naoto; Wurst, Wolfgang; Niessing, Dierk & Heissmeyer, Vigo
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The function of Wtap in N6-adenosine methylation of mRNAs controls T cell receptor signaling and survival of T cells. Nature Immunology, 23(8), 1208-1221.
Ito-Kureha, Taku; Leoni, Cristina; Borland, Kayla; Cantini, Giulia; Bataclan, Marian; Metzger, Rebecca N.; Ammann, Gregor; Krug, Anne B.; Marsico, Annalisa; Kaiser, Stefanie; Canzar, Stefan; Feske, Stefan; Monticelli, Silvia; König, Julian & Heissmeyer, Vigo
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Critical functions of N6-adenosine methylation of mRNAs in T cells. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research, 1870(1), 119380.
Ito-Kureha, Taku & Heissmeyer, Vigo
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The mRNA methyltransferase Mettl3 modulates cytokine mRNA stability and limits functional responses in mast cells. Nature Communications, 14(1).
Leoni, Cristina; Bataclan, Marian; Ito-Kureha, Taku; Heissmeyer, Vigo & Monticelli, Silvia
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Unrestrained cleavage of Roquin-1 by MALT1 induces spontaneous T cell activation and the development of autoimmunity. Proceedings of the National Academy of Sciences, 120(48).
Schmidt, Henrik; Raj, Timsse; O.'Neill, Thomas J.; Muschaweckh, Andreas; Giesert, Florian; Negraschus, Arlinda; Hoefig, Kai P.; Behrens, Gesine; Esser, Lena; Baumann, Christina; Feederle, Regina; Plaza-Sirvent, Carlos; Geerlof, Arie; Gewies, Andreas; Isay, Sophie E.; Ruland, Jürgen; Schmitz, Ingo; Wurst, Wolfgang; Korn, Thomas ... & Heissmeyer, Vigo
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TGF-β specifies T FH versus T H 17 cell fates in murine CD4 + T cells through c-Maf. Science Immunology, 9(93).
Chang, Yinshui; Bach, Luisa; Hasiuk, Marko; Wen, Lifen; Elmzzahi, Tarek; Tsui, Carlson; Gutiérrez-Melo, Nicolás; Steffen, Teresa; Utzschneider, Daniel T.; Raj, Timsse; Jost, Paul Jonas; Heink, Sylvia; Cheng, Jingyuan; Burton, Oliver T.; Zeiträg, Julia; Alterauge, Dominik; Dahlström, Frank; Becker, Jennifer-Christin; Kastl, Melanie ... & Baumjohann, Dirk
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The thymocyte-specific RNA-binding protein Arpp21 provides TCR repertoire diversity by binding to the 3’-UTR and promoting Rag1 mRNA expression. Nature Communications, 15(1).
Xu, Meng; Ito-Kureha, Taku; Kang, Hyun-Seo; Chernev, Aleksandar; Raj, Timsse; Hoefig, Kai P.; Hohn, Christine; Giesert, Florian; Wang, Yinhu; Pan, Wenliang; Ziętara, Natalia; Straub, Tobias; Feederle, Regina; Daniel, Carolin; Adler, Barbara; König, Julian; Feske, Stefan; Tsokos, George C.; Wurst, Wolfgang ... & Heissmeyer, Vigo
