Räumliche Analyse antigen-spezifischer humaner tumor-infiltrierender Lymphozyten unter Verwendung einer neuen Antigen-Reporter-Plattform

• Antragstellerin: Dr. Xiaojing Chen
• Fachliche Zuordnung: Immunologie ; Biochemie ; Bioverfahrenstechnik
• Förderung: Förderung von 2021 bis 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 456456433

Ziel des Projektes ist die Gewinnung neuer Erkenntnisse hinsichtlich der Tumor-T-Zell-Interaktion durch räumliche Analyse Tumor-infiltrierender Lymphozyten (TILs) unter Verwendung einer neuartigen Antigen-Reporter-Plattform. Diese zellbasierte antigen-Reporter-Plattform kombiniert auf Basis der Proteinstruktur gestützt entwickelte Biosensoren mit einer cDNA Bibliothek potentieller Tumorantigene, welche aus Tumorzellen gewonnen wurde. Mit Hilfe dieser Plattform sollen sowohl unveränderter Selbstantigene als auch Neo-Antigene, die von TILs erkannt werden, identifiziert werden. Durch deutliche Reduktion der möglichen antigenen Proteine auf einige wenige natürlich vokommende Proteine (gegenüber großen zufälligen Peptidbibliotheken) wird die Anzahl potentieller Peptide deutlich eingegrenzt, wodurch bei geringerem Material- und Zeitverbrauch eine robustere Zuordnung zu identifizierten Peptiden erfolgen kann.Durch das Projekt sollen außerdem Erkenntnisse über Grundlagen der T-Zell-Biologie gewonnen werden, z.B. ein besseres Verständnis der Regeln der Antigenprozessierung und –präsentation. Die Verbindung der Kenntnis über tatsächlich prozessierte T-Zell-Antigene mit theoretischen Algorithmen sollte zu einer verbesserten Vorhersage von T-Zell-Antigenen führen.

• DFG-Verfahren: WBP Stipendium
• Internationaler Bezug: USA
• Gastgeber: Professor K. Christopher Garcia, Ph.D.