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Funktionelle proteogenomische Charakterisierung des Mantelzell-Lymphoms

Antragsteller Dr. Julius Enßle
Fachliche Zuordnung Hämatologie, Onkologie
Förderung Förderung von 2021 bis 2023
Projektkennung Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 463138470
 
Erstellungsjahr 2024

Zusammenfassung der Projektergebnisse

Das Mantelzell-Lymphom (MCL) ist ein B-Zell Non-Hodgkin Lymphom (B-NHL), welches durch molekulare und klinische Heterogenität charakterisiert ist. Trotz neuer Therapieansätze, welche zielgerichtete Substanzen, Immunchemotherapie sowie zelluläre Therapie umfassen, zeigt sich häufig eine Therapieresistenz und das Auftreten von Rezidiven. Somit ist es höchst relevant das MCL umfassend unter Einbeziehung aller molekularen Ebenen zu charakterisieren, um Hoch-Risiko Patient:innen zu identifizieren und neue Therapiestrategien zielgerichtet einsetzen zu können. Entsprechend erfolgte in diesem Projekt die proteogenomische Aufarbeitung von 261 Patient:innen mit neu diagnostiziertem MCL. Dabei wurden mittels RNA-Sequenzierung transkriptionelle Expressionsdaten sowie durch quantitative massenspektrometrische Messung Proteinexpressionsdaten aus dem vorliegenden Gewebsmaterial erzeugt. Die bioinformatische Integration der einzelnen Expressionsebenen erfolgte mittels latenter Variablen-Modellierung. Aus der dabei generierten latenten Repräsentanz aller Expressionsebenen konnten verschiedene robuste Proteogenotypen abgeleitet werden, die sich hinsichtlich des Gesamtüberlebens deutlich unterscheiden. Interessanterweise zeigten diese kaum Überlappung mit den bisher beschriebenen MCL-Risikofaktoren, Krankheitscharakteristika oder morphologischen Phänotypen. Im Einzelnen konnten klare molekulare Motive und biologische Eigenschaften den MCL Proteogenotypen zugeschrieben werden, welche beispielsweise charakteristische Merkmale der Tumor Proliferation, Immunzell-Signale und Gewebsinfiltration mit umfassen. Zusammengefasst erweitern diese Daten die bisherige biologische Klassifikation des MCLs durch die Einführung der Proteogenotypen mit prognostischer Relevanz. Zudem stellt der erzeugte multimodale Datensatz eine umfassende Ressource für weitere molekulare und translationale Forschungsprojekte im MCL dar.

Projektbezogene Publikationen (Auswahl)

 
 

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