Functional and structural characterization of small molecule interactions with ion channels

• Applicants: Dr. Stefan Becker, since 8/2008; Professor Dr. Olaf Pongs
• Subject Area: Analytical Chemistry
• Term: from 2007 to 2012
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 49947431

• Final Report Year: 2012

Final Report Abstract

Wie in unserem Arbeitsprogramm vorgesehen, ist es uns gelungen, wesentliche neue Erkenntnisse zur Wirkung eines Kleinmoleküls auf das Schaltverhalten des KcsA-Kv1.3 Kanals zu erhalten. In diesem Zusammenhang wurden neue Erkenntnisse zur Kopplung von Aktivierungs- und Inaktivierungsgate erhalten. Die Ergebnisse sind von allgemeiner Bedeutung für das Schaltverhalten von lonenkanälen und den zugrunde liegenden Konformationsänderungen in der Porendomäne.

Publications

• (2008) A structural link between inactivation and block of a K+ channel. Nature Struct. Mol. Biol. 15, 605-612
  Ader C, Schneider R, Hornig S, Velisetty P, Wilson E, Lange A, Giller K, Ohmert I, Eauclaire M F, Trauner D, Becker S, Pongs O and Baldus M
  
• (2009) Coupling of activation and inactivation gate in a K(+)-channel: potassium and ligand sensitivity. EMBO J. 18, 2825-34
  Ader C, Schneider R, Hornig S, Velisetty P, Vardanyan V, Giller K, Ohmert I, Becker S, Pongs O, Baldus M
  
• „Crystalline, membrane-embedded and fibrillar proteins investigated by solid-state NMR spectroscopy", Dissertation Universität Göttingen, 2009
  Robert Schneider
  
• „Inhibition spannungsabhängiger Kaliumkanäle aus Rattus norvegicus (John Berkenhout, 1769) durch einen allosterischen Effektor", Dissertation Universität Hamburg, 2009
  Sönke Hornig
  
• „Selective Membrane Transport Systems studied by solid-state NMR spectroscopy ", Dissertation Universität Utrecht, 2009
  Christian Ader
  
• (2010) Protein dynamics detected in a membrane-embedded potassium channel using two-dimensional solid-state NMR spectroscopy. Biochim Biophys Acta, 1798,286-90
  Ader C, Pongs O, Becker S, Baldus M
  
• „Inactivation gating of potassium chaimels", Dissertation Universität Hamburg, 2010
  Phanindra Velisetty