Ribosome rearrangements during translocation

• Applicant: Professor Dr. Wolfgang Wintermeyer
• Subject Area: Cell Biology
• Term: from 1997 to 2009
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5078480

Elongationsfaktor G (EF-G) unterscheidet sich von anderen GTPasen dadurch, dass er nicht als Schalter sondern als mechanochemisches Protein arbeitet, das infolge der GTP-Hydrolyse eine Konformationsänderung erfährt, die auf das Ribosom übertragen wird und zur tRNA-Translokation führt. Dieses Modell soll weiter untersucht werden. Die molekulare Mechanik von EF-G soll durch Aminosäuresubstitution an den Kontaktstellen zwischen den Domänen 1 und 5, die funktionell besonders wichtig zu sein scheinen, gezielt beeinflusst werden. Weiter soll die Funktion der G'-Subdomäne des EF-G, die andere GTPasen und Translationsfaktoren nicht aufweisen, durch Aminosäuresubstitution untersucht werden. Strukturveränderungen des EF-G und des Ribosoms während der Translokation sollen durch Cryoelektronenmikroskopie weiter charakterisiert werden. Weiter soll die Konformationsdynamik des EF-G durch Messung des intramolekularen Fluoreszenzenergietransfers gemessen und kinetisch charakterisierten Redaktionsschritten am Ribosom zugeordnet werden. Schließlich sollen Konformationsveränderungen des Ribosoms während der Translokation durch chemische Modifizierung der ribosomalen RNA lokalisiert werden.

• DFG Programme: Research Grants
• International Connection: Russia
• Participating Person: Dr. Yuri P. Semenkov