Neurospora Genomprojekt

• Applicant: Privatdozent Dr. Ulrich Schulte
• Subject Area: Biochemistry
• Term: from 1998 to 2004
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5091928

Das deutsche Neurospora Genomprojekt mit dem Ziel die Chromosomen II und V der insgesamt 7 Chromosomen des Pilzes zu sequenzieren hat große Fortschritte gemacht. Im laufenden 2. Förderjahr wurde etwa die Hälfte der zu erwartenden Sequenzdaten bestimmt und in einer Datenbank zur allgemeinen Nutzung zur Verfügung gestellt. Zusätzlich zu den Nuleinsäuresequenzen wird eine automatisierte Analyse und Auswertung der Daten bereitgestellt. Anmerkung: Für die Sequenzierung sind zusätzliche Mittel notwendig, da wesentlich mehr Cosmide sequenziert werden müssen als vorgesehen war und da zur gezielteren Auswahl gering überlappender Klone Endsequenzierungen erforderlich sind. Die in Cosmiden enthaltenen genomischen Fragmente sind mit 35 kbp nur etwa halb so groß wie die Fragmente in den BAC-Klonen. Daher ist einerseits das Vektor zu Insert-Verhältnis ungünstiger und andrerseits die Zahl der zu bearbeitenden Klone doppelt so hoch. Weiterhin erweisen sich wie schon berichtet viele Cosmide im Verlauf der Bearbeitung als ungeeignet.Beantragt werden zusätzliche Mittel in Höhe von 824.644 DM für die Sequenzierung.

• DFG Programme: Research Grants
• Participating Persons: Professor Dr. Wolf-Hubert Kunau; Dr. Josef Maier; Professor Dr. Walter Neupert (†); Professorin Dr. Helga Ninnemann (†); Professor Dr. Ludger Rensing; Professor Dr. Manfred Schliwa; Professor Dr. Maximilian Tropschug; Professor Dr. Hanns Weiss