7-Substituierte 8-Aza-7-desazapurine (Pyrazolo[3,4-d]pyrimidine) als Substitute von Purin-Basen in synthetischer DNA

• Antragsteller: Professor Dr. Frank Seela
• Fachliche Zuordnung: Organische Molekülchemie - Synthese, Charakterisierung
• Förderung: Förderung von 1999 bis 2005
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5226764

Die Watson-Crick Basenerkennung ist von eminenter Bedeutung für die Diagnose genetischer und infektiöser Krankheiten, sowie anderer z. B. forensischer Untersuchungen, die auf dem Nachweis geringster DNA-Mengen beruhen. In diesem Zusammenhang ist die Stabilisierung von Watson-Crick Basenpaaren in OligonucleotidDuplexen, sowie die Markierung von DNA mit Reportergruppen an räumlich unproblematischer Position von großem Interesse. Das Projekt beschreibt die Entwicklung von DNA-Synthesebausteinen auf der Basis strukturell modifizierter Purin-Basen mit unveränderter Watson-Crick Flanke. Zu diesem Zweck werden Pyrazolo[3,4-d]pyrimidine (=8-Aza-7-desazapurine; im Antrag wird ausschließlich die Purin-Zählweise verwandt) mit 7-Substituenten versehen, in Nucleoside umgewandelt und danach in Phosphoramidite übergeführt. Diese Synthesebausteine finden Eingang in die Festphasensynthese, wodurch Oligonucleotide zugänglich werden, deren Purinbasen an jeder beliebigen Position durch 8-Aza7-desazapurine mit gewählten 7-Substituenten ausgetauscht sind. Die Stabilität der DNA-Duplexe wird nach Hybridisierung der Einzelstränge aus TmWerten bestimmt und mit der der PurinStammoligomere verglichen. Darüber hinaus sollten in 8-Aza-7desazapurine Seitenketten mit Reportergruppen eingeführt und diese als diagnostische Proben verwendet werden.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen
• Internationaler Bezug: Schweden
• Beteiligte Person: Professor Dr. Rudolf Rigler