Nachweis und funktionelle Analyse von Trans-Spleißen am Chromatingen mod(mdg4)/E(var)3-93D bei Drosophila melanogaster - Funktionelle Analyse von mRNA Trans-Spleißen am mod(mdg4) Locus

• Applicant: Dr. Rainer Dorn
• Subject Area: General Genetics and Functional Genome Biology
• Term: from 2000 to 2008
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5227830

Das Enhancergen für Positionseffekt-Variegation E(var)3-93D kodiert für eine Familie von mehr als 20 Chromatinproteinen, die auf differentielles mRNA Spleißen zurückzuführen sind. Alle identifizierten Protein-Isoformen haben einen gemeinsamen N-Terminus von 402 Aminosäuren, unterscheiden sich jedoch in den C-terminalen Bereichen (28-208 Aminosäuren). Immunologische Analysen zeigten, daß sich einzelne Protein-Isoformen in der Bindungsspezifität an Polytänchromosomen signifikant unterscheiden, was ein klarer Hinweis auf eine funktionelle Differenzierung der E(var)3-93D Proteinisoformen ist.Die Kodierung der spezifischen Exons von beiden antiparallelen Strängen spricht für die Entstehung unabhängiger Transkripte für den gemeinsamen 5'Bereich einerseits und die entsprechenden spezifischen Exons andererseits, sowie deren Verknüpfung durch trans Spleißen. Der erstmalige experimentelle Nachweis von trans-Spleißen bei Drosophila, sowie funktionelle Analysen zur Regulation der komplexen Spleißrozesse bei E(var)3-93D sollen einen wesentlichen Schwerpunkt des Antrages bilden.Die im Rahmen der Vorarbeiten erhaltenen und charakterisierten Antiseren gegen E(var)3-93D Proteine sollen zur Identifizierung und Analyse von Chromatinkomplexen eingesetzt werden. Durch Co-Immunpräzipitation sollen putative Interaktionspartner für zwei immunologisch charakterisierte Protein-Isoformen isoliert werden.

• DFG Programme: Research Grants