Protein-Nukleinsäurewechselwirkungen als Funktionsgrundlage von RNA-Enyzmen: Ribonuklease P aus Pflanzen als Modellsysteme

• Applicant: Privatdozentin Dr. Astrid Schön
• Subject Area: Plant Biochemistry and Biophysics
• Term: from 2000 to 2010
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5235756

• Final Report Year: 2010

Final Report Abstract

Die Crosslink-Ergebnisse zeigen bei der Prochlorococcus-RNA einen völlig neuartigen Substratbindungsmodus. Mit der Cyanellen-RNase P-RNA wurde das erste Ribozym aus einem Plastiden identifiziert. Die bioinformatische Analyse pflanzlicher MRP-RNAs (Kooperation mit Prof. Stadler) führte zu einem neuen Strukturmodell. Der gleichzeitige Nachweis von RNase P-Aktivität und RNase MRP-RNA, sowie den Reaktionsprodukten beider Enzyme (tRNAs und rRNAs) in Immunopräzipitaten zeigt nicht nur, dass die beiden Enzyme nah verwandt sind, sondern lässt auch Raum für weitere Fragen nach dem Aufbau der pflanzlichen nukleären RNase P: Der aktuelle Wissensstand lässt eine enge Assoziation beider Aktivitäten in einem einzigen Enzymkomplex vermuten, wobei die bisher als RNase MRP-RNA bezeichnete RNA-Komponente möglicherweise beide Funktionen ausführt. Die noch offenen Fragen können jedoch in meiner Arbeitsgruppe unter den aktuellen Bedingungen leider nicht beantwortet werden.

Publications

• (2002) Conserved and variable domains within divergent RNase P RNA gene sequences of Prochlorococcus strains. Int. J. Appl. Syst. Bacteriol. 52, 1383–1389
  Schön, A., Fingerhut, C. and Hess, W. R.
  
• (2005) Direct determination of RNA sequence and modification by radiolabeling methods. In: Methods in RNA Biochemistry. Hartmann, R. K., Bindereif, A., Schön, A. and Westhof, E. (eds). Wiley-VCH: pp. 133-150
  Gimple, O. and Schön, A.
  
• (2005) Enzymatic RNA synthesis using Bacteriophage T7 RNA polymerase. In: Methods in RNA Biochemistry. Hartmann, R. K., Bindereif, A., Schön, A. and Westhof, E. (eds). Wiley-VCH: pp. 3-21
  Gruegelsiepe, H., Schön, A., Kirsebom, L. A. and Hartmann, R.K.
  
• (2007) RNase P of the Cyanophora paradoxa cyanelle: A plastid ribozyme. Biochimie 89, 1528-38
  Li, D., Willkomm, D. K., Schön, A. and Hartmann, R. K.
  
• (2009) Fatty Acid α-Dioxygenase from Pisum sativum: Temporal and Spatial Regulation of Fatty Acid Metabolism during Germination and Plant Development. J. Plant Physiol.166, 333-43 (Epub 2008 Aug 28)
  Meisner, A., Saffert, A., Schreier, P. and Schön, A.