Konstruktion eines Microarrays zur Bestimmung der differentiellen Expression nukleär kodierter mitochondrialer Proteine des Menschen - Konstruktion eines SNP-Chip zur Messung von Variationen in mt Proteinen

• Applicant: Dr. Curt Scharfe
• Subject Area: Human Genetics
• Term: from 2000 to 2002
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5236632

Das Verständnis komplexer Erkrankungen erfordert die funktionelle Charakterisierung aller Proteine und ihrer Interaktion eines Organismus. Die Microarray-Technologie liefert quantitative Informationen über zelluläre Prozesse und deren Modulation. Das Potential der Microarray-Technik soll am Beispiel eines Organells, des Mitochondriums, erprobt werden. Die Konservierung mitochondrialer Proteine und Prozesse in der Evolution zwischen den Spezies ermöglicht die Übertragbarkeit der Untersuchungen an Modellorganismen auf humane Zellen. In diesem Forschungsvorhaben soll durch Messung differentieller Genexpression mitochondrialer Hefe-Mutanten ein Verständnis der zellulären Regulation für ausgewählte Stoffwechselwege (Atmungskette, Eisenstoffwechsel, Proteasen) erreicht werden. Die Konstruktion eines cDNA-Chips mit Genen, die für mitochondriale Proteine kodieren (MITO-Gene) sollen Expressionsmessungen, analog zu den ausgewählten Stoffwechselwegen der Hefe, ermöglichen. Diese Technologie wird für ein im Deutschen Humangenomprojekt gefördertes Vorhaben (MITOP) nutzbar gemacht, und die Ergebnisse fließen durch direkte Anbindung in die Untersuchungen der Gruppe ein. Zur Untersuchung der Bedeutung von SequenzVarianten in Genen bei häufigen und komplexen Erkrankungen soll ein SNP-Chip speziell für MITO-Gene konstruiert werden.

• DFG Programme: Research Fellowships