Biocomputing der Organisation von Chromatinstrukturen auf großen Längenskalen

• Applicant: Professor Dr. Christoph Cremer
• Subject Area: Biophysics
• Term: from 2001 to 2004
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5306208

Bei dem hier vorgeschlagenen Biocomputing-Projekt soll die dreidimensionale dynamische Organisation bzw. Verteilung von Chromosomen-territorien und -domänen im Zellkern auf geometrische Randbedingungen hin untersucht werden. Dazu soll ein im Rahmen des o.g. Graduiertenkollegs im Forschungsbereich Angewandte Optik & Informationsverarbeitung des Kirchhoff Instituts für Physik der Universität Heidelberg (Leiter: C. Cremer) entwickeltes Computermodell der dreidimensionalen (3D) "Groß"Struktur des gesamten menschlichen Genoms ("Large Scale Chromatin Structure" weiterentwickelt und seine experimentell testbaren Konsequenzen unter verschiedenen vorgegebenen Randbedingungen berechnet werden. Gesamtziel der Untersuchungen ist es, zur Frage eines Zusammenhangs zwischen der "Groß"Struktur des menschlichen Genoms und funktionell bedeutsamen Größen beizutragen. Die geplante Dynamisierung dieses Modells mit Brownscher Dynamik wird dabei einen zeitlichen Überblick über das Bewegungsverhalten ganzer Chromosomenterritorien und seiner Subkompartimente ermöglichen. Die aus den entwickelten Modellen berechneten experimentell testbaren Parameter sollen soweit vorhanden, mit bekannten Werten aus der Literatur verglichen werden.

• DFG Programme: Research Grants