Statistische Physik von Multiple-Alignment Algorithmen

• Applicant: Dr. Peter Arndt
• Subject Area: Theoretical Condensed Matter Physics
• Term: from 2001 to 2004
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5314406

Mit diesem interdisziplinären (Physik/Biologie/Informatik) Forschungsprojekt sollen die statistischen Eigenschaften von Multiple Alignment Algorithmen bestimmt werden. Diese Algorithmen kommen bei der Suche von verwandten Teilsequenzen innerhalb von mehreren DNA oder Protein Sequenzen zum Einsatz und erlauben es, strukturelle oder funktionelle Ähnlichkeiten zu finden. Sie werden deshalb eine große Rolle bei der zukünftigen Analyse von genetischen Daten spielen. Für die Anwendung dieser Algorithmen ist es unerläßlich, die Signifikanz eines Ergebnisses zu quantifizieren. Dazu sind zunächst Verteilungsfunktionen zu bestimmen. Es können Methoden aus der Theoretischen Physik herangezogen werden, um fruchtbare Ergebnisse zu liefern. Ziel ist es, mit Hilfe dieser Algorithmen ein verläßliches Werkzeug der molekularbiologischen Forschung und Entwicklung zu schaffen.

• DFG Programme: Research Fellowships
• International Connection: USA
• Cooperation Partners: Professor Dr. Terence Hwa; Professor Dr. Michael Lässig