Identification of targets of transcriptional activators in intact transcription complexes

• Applicant: Privatdozent Dr. Karsten Melcher
• Subject Area: Metabolism, Biochemistry and Genetics of Microorganisms
• Term: from 2001 to 2004
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5334162

Am Ende der meisten Signaltransduktionsketten, die zu einer Genaktivierung führen, steht die durch Transkriptionsaktivatoren vermittelte Rekrutierung des Transkriptionsapparats an den Promotor. Sie erfolgt durch Interaktion der Aktivierungsdomänen der Transkriptionsaktivatoren mit Komponenten des Transkriptionsapparats und Chromatin modifizierender Komplexe. Die eindeutige Identifizierung der direkten Aktivierungsdomänen-Targets hat sich jedoch trotz ihrer enormen Bedeutung als außerordentlich kompliziert und Artefakt-gefährdet erwiesen. Bei Experimenten mit isolierten Polypeptiden sind die identifizierten Interaktionen relativ schwach, nur moderat spezifisch und erfolgen über exponierte hydrophobe Aminosäuren, wie sie auch artifiziell in isolierten Polypeptiden außerhalb ihres physiologische Multiproteinkomplex-Kontextes vorkommen können. Ziel dieses Projekts ist es deshalb, mit Hilfe einer neuesten Methode die direkten Interaktionspartner von Aktivierungsdomänen unter physiologischen Bedingungen im Kontext intakter Transkriptionskomplexe zu identifizieren.

• DFG Programme: Research Grants