Erstellung und Analyse von Genexpressionsprofilen zur Untersuchung der Karzinogenese bei chronisch-entzündlichen Darmerkrankungen

• Applicant: Dr. Frank Staib
• Subject Area: Gastroenterology
• Term: from 2001 to 2006
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5347739

Das Ziel des angestrebten Stipendiums ist es neue Kenntnisse und Einblicke in die Mechanismen der durch oxidativen Stress induzierten Karzinogenese bei chronisch-entzündlichen Darmerkrankungen durch Einsatz neuer Methoden - Genexpressionsanalysen mit dem cDNA-Microarray-Assay und der Laser-Capture-Microdissection - zu gewinnen. In der Pathogenese dieser Neoplasien spielen die beiden Enzyme NOS-2 und COX-2, die unter dem regulatorischen Einfluss des Tumorsuppressorgens p53 stehen, eine zentrale Rolle. So kann NOS-2 durch die Entstehung von hochreaktiven NO-Verbindungen zu DNA-Schäden oder Genmutationen führen, während COX-2 u.a. VEGF-vermittelt zur Tumorpromotion beiträgt. In neuen in vitro und in vivo Modellen mit transfizierten und Gen-defizienten Zelllinien und Mäusen (z.B. einer IL-10/COX-2 Doppelknockout-Maus), sollen weitere Gene, die in der Regulation von NOS-2 und COX-2 und der Karzinogenese bei CED beteiligt sind, anhand von Genexpressionsprofilen identifiziert werden. Hierfür werden cDNA-Microarray-Untersuchungen von normalen Geweben, von entzündeten, präneoplastischen und schließlich neoplastischen Geweben - auch unter dem Einfluß entsprechender Enzyminhibitoren - durchgeführt und die Ergebnisse mit Hilfe verschiedener Datenbanken sowie bioinformatischen und statistischen Algorithmen analysiert.

• DFG Programme: Research Fellowships