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Biochemistry and biological function of mammalian Dnmt1

Subject Area Biochemistry
Term from 2002 to 2009
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5370240
 
Final Report Year 2010

Final Report Abstract

DNA-Methylierung ist eine essentielle Modifikation in menschlicher DNA, die in beiden DNA-Strängen an CpG-Sequenzen von sogenannten DNA-Methyltransferasen eingebaut wird. Diese Sequenzen werden im Zuge der DNA-Replikation in einen hemimethylierten Zustand überführt. Diese Sequenzen werden von der Dnmt1-Methyltransferase erkannt und wieder in den vollmethylierten Zustand überführt. Ziel der Arbeiten war es, die Eigenschaften der Dnmt1-Methyltransferase, die mit diesem Prozess in Verbindung stehen, zu untersuchen. Wir konnten mit zwei komplementären experimentellen Ansätzen zeigen, dass Dnmt1 die DNA sehr prozessiv methyliert, d.h. dass das Enzym einmal an die DNA bindet und danach an mehreren hemimethylierten CpG-Stellen eine Methylierung einbringt. Dabei gleitet das Enzym an der DNA entlang in einem Vorgang der als lineare Diffusion bezeichnet wird. Es bleibt dabei in engem Kontakt mit der DNA und kann auch jeweils nur in einen DNA-Strang Methylgruppen einbringen. Weiterhin konnten wir zeigen, dass Dnmt1 ein 10-100 fache Präferenz für die Methylierung von hemimethylierten Sites aufweist, wodurch die Stabilität der Methylierungsmuster sichergestellt wird. In weiteren Arbeiten konnten wir zeigen, dass Dnmt1 auch bei der sogenannten de novo Methylierung mit Dnmt3-Enzymen kooperiert und bei diesem Vorgang ebenfalls eine wichtige Rolle spielt. In weiteren Projekten konnten wir zeigen, dass eine Phosphorylierung von Dnmt1 an Serin 515 für die Aktivität des Enzyms wesentlich ist, was erste Einblicke in die Regulation dieses Enzyms erbracht hat, und dass an Nukleosomen gebundene DNA ein schlechtes Substrat für Dnmt1 ist.

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