Stochastische Simulation von miteinander reagierenden RNA-Molekülen (A04)

• Fachliche Zuordnung: Statistische Physik, Nichtlineare Dynamik, Komplexe Systeme, Weiche und fluide Materie, Biologische Physik
• Förderung: Förderung seit 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 521256690

Pools von miteinander reagierenden RNA-Molekülen sind ein möglicher Ausgangspunkt für die molekulare Evolution. Solche RNA-Pools führen jedoch zu einer überwältigenden kombinatorischen Komplexität möglicher Wechselwirkungen und Reaktionen, die auf Hybridisierung, Ligation, Spaltung, Strangverschiebung und Selbstfaltung von RNA Strängen beruhen. Effiziente Simulationsansätze sind erforderlich, um die entstehende globale Dynamik zu charakterisieren. Dieses Projekt zielt darauf ab, (i) eine stochastische "RNA-Reaktor"-Simulation zu erstellen, die einen Großteil dieser kombinatorischen Komplexität erfassen kann, und (ii) diesen RNA-Reaktor zu nutzen, um unser Verständnis der experimentellen Systeme innerhalb dieses SFBs zu verbessern.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 392: Molekulare Evolution in präbiotischen Umgebungen
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Ulrich Gerland, seit 1/2024