Determination of the solution structure of the human GABA receptor associated protein (GABARAP) and its complexes with protein and peptide ligands
Final Report Abstract
Wir konnten in den letzten Jahren entscheidende Beiträge zur Aufklärung der funktionellen und der strukturellen Eigenschaften der GABARAP-artigen Proteine leisten. Seit 2002 wurden vier von insgesamt 14 neuen GABARAP-Liganden von uns identifiziert. Die Kenntnis der Interaktionspartner hilft beim Verständnis der zellulären GABARAP-enthaltenden Protein-Protein-Netzwerke und damit der GABARAP-Funktion im lebenden Organismus. Neben der Identifizierung von bisher unbekannten GABARAP-Liganden ist die strukturelle Charakterisierung ohne und mit Liganden ein wichtiges Instrument zur Aufklärung der physiologischen Wirkungsweise von GABARAP und möglichen Konsequenzen einer Störung. Die von unserer Arbeitsgruppe veröffentlichte Lösungsstruktur war die erste NMR-Struktur von GABARAP. Auch die von uns bestimmte Struktur des GABARAP-orthologen Proteins in Hefe, Atg8, bildet eine wichtige Grundlage für zukünftige Untersuchungen. Der Einsatz von Nanodiscs für die funktionelle und strukturelle Untersuchung von lipidiertem GABARAP ist ebenfalls eine wichtige Voraussetzung für zukünftige Studien in diesem Projekt.
Publications
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Mohrlüder J, Schwarten M, Willbold D
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