NMR-Studies of molecular interactions between Caracurine V Analogs and the muscle-type of nicotinic acetylcholine receptors from Torpedo californica

• Applicant: Dr. Darius Paul Zlotos
• Subject Area: Pharmacy
• Term: from 2002 to 2003
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5373114

Ziel des Forschungsprojekts ist die Charakterisierung von Bindungsstellen bisquartärer Caracurin V Salze am muskulären Typ des nicotinischen Acetylcholin-Rezeptors (nAChR) mit Hilfe multidimensionaler NMR-Spektroskopie. Radioligand-Bindindstudien und eine große strukturelle Ählichkeit der Caracurine mit den potenten Muskelrelaxantien Toxiferin und Alcuronium sprechen dafür, dass es sich ebenfalls um potente kompetitive Antagonisten am nAChR handelt. Zunächst wird ein mit 15N angereichertes Protein-Fragment hergestellt, das die gleiche Aminosäurensequenz aufweist, wie die vermutete Antagonist-Bindungsdomäne des nativen Rezeptors. Differenzen von chemischen Verschiebungen der 15N- 1H Paare im zweidimensionalen 15N-HSQCExperiment (heteronuclear single quantum correlation) vor und nach dem Binden eines affinen Caracurins sollen nun die Aminosäuren ausfindig machen, die an der Bindung des Liganden beteiligt sind. Die Methode könnte eine hochaufgelöste Struktur eines Komplexes zwischen den potentesten Carcurinen und der nAChR -Erkennungssequenz liefern.

• DFG Programme: Research Fellowships