FOR 5806:  Funktionelle Genomik und Mikrobiomik in der Präzisionsmedizin des kolorektalen Karzinoms

• Fachliche Zuordnung: Medizin
• Förderung: Förderung seit 2025
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 537604907

Darmkrebs macht etwa 10% aller Krebserkrankungen aus und ist weltweit die zweithäufigste krebsbedingte Todesursache. Von der genombasierten Präzisionsmedizin erhoffte man sich eine Verbesserung der Überlebenschancen, indem die Behandlung auf die spezifischen molekularen Veränderungen zugeschnitten wird, die diesen und anderen Krebsarten zugrunde liegen. Personalisierte Therapiestrategien auf Basis der Genomsequenzierung konnten jedoch in prospektiven Studien nur für weniger als 20% der Patient:innen identifiziert werden. Der bislang begrenzte Erfolg dieser Strategie unterstreicht die Notwendigkeit die komplexen, dynamischen und heterogenen Genotypen und Phänotypen tumorassoziierter Ökosysteme besser in diese Strategien zu integrieren. Die kürzlich beschriebene Schnittstelle zwischen Mikrobiota, tumorassoziierten Genen und (zielgerichteten) Medikamenten ist dabei ein bislang wenig erforschter Teil dieser Ökosysteme, die möglicherweise eine gezieltere Behandlung von Darmkrebs ermöglichen könnte. Unsere Forschungsgruppe GenoMiCC besteht aus einer geschlechterparitätisch besetzten Gruppe von 17 Wissenschaftler:innen (inklusive 6 Nachwuchswissenschaftler:innen), die gemeinsam 8 wissenschaftliche und 2 zentrale Projekten leiten. Mit dieser Gruppe von exzellenten Wissenschaftler:innen decken wir das gesamte Spektrum der Expertise ab, um die funktionelle Genomik und Mikrobiomik in der Präzisionsmedizin des Darmkrebses zu untersuchen. Gemeinsam wollen wir damit neue zielgerichtete und personalisierte Therapieansätze identifizieren und entwickeln. Dazu wird unser Team aus Grundlagen- und klinischen Wissenschaftlern bestehende Kooperationen ausbauen und neue Erkenntnisse aus unserer Forschung für die Entwicklung neuartiger klinischer Studien der Präzisionsmedizin des Darmkrebses nutzen.

• DFG-Verfahren: Forschungsgruppen
• Internationaler Bezug: Schweiz

Projekte

• Analyse der Rolle des Mikrobioms auf die zelluläre Plastizität des fortgeschrittenen kolorektalen Karzinoms und deren Beitrag zur Therapieresistenz (Antragsteller Jackstadt, Rene-Filip )
• Analyse von Metaboliten aus dem Darmmikrobiom als Modulatoren der tumoreigenen Immunogenität in den Lebermetastasen des kolorektalen Karzinoms (Antragstellerinnen / Antragsteller Rauber, Conrad ;  Roberti, Ph.D., Maria Paula )
• Auswirkungen des Darmmikrobiom-vermittelten Arzneimittelstoffwechsels auf das Therapieansprechen beim kolorektalen Karzinom (Antragstellerinnen / Antragsteller Zhan, Tianzuo ;  Zimmermann, Maria )
• Datenmanagement, -integration and -analyse (Antragstellerinnen / Antragsteller Betge, Johannes ;  Zimmermann, Maria )
• Einfluss mikrobieller Metabolite auf die Translationskontrolle bei der Therapieresistenz des kolorektalen Karzinoms (Antragstellerinnen / Antragsteller Betge, Johannes ;  Schott, Johanna )
• Entschlüsselung der Rolle mikrobieller Metabolite bei der Modulation der MAPK- und Wnt-Signalwege und der Therapieresistenz beim kolorektalen Karzinom (Antragsteller Boutros, Michael ;  Ebert, Matthias )
• Funktionelle Mikrobiom- und Metabolomforschung (Antragsteller Zimmermann, Ph.D., Michael )
• Kombination von synthetischer Biologie und Organ-on-a-Chip-Technologie zur Entwicklung molekularer und mikrobieller Co-Behandlungsstrategien für eine bessere Medikamentenverfügbarkeit und Zugänglichkeit von wichtigen Zielstrukturen beim kolorektalen Karzinom (Antragstellerin Schubert, Antonia )
• Koordinationsfonds (Antragsteller Ebert, Matthias )
• Mikrobielle Einflüsse auf den Metabolismus von Lebermetastasen des kolorektalen Karzinoms und deren Bedeutung für das Therapieansprechen (Antragstellerinnen / Antragsteller Hinze, Laura ;  Puschhof, Jens )
• Räumliche und funktionelle Analyse intratumoraler Mikrobiota und deren Einfluss auf das Therapieansprechen beim kolorektalen Karzinom (Antragstellerin Burgermeister, Elke )

• Sprecher: Professor Dr. Matthias Ebert