Charakterisierung des mitochondrialen Transkriptoms aus Arabidopsis thaliana als Basis für die Funktionsanalyse von Enzymen des RNA-Metabolismus

• Applicant: Professor Dr. Stefan Binder
• Subject Area: Plant Genetics and Genomics
• Term: from 2002 to 2007
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5383489

In dem geplanten Projekt soll ein genaues Bild des mitochondrialen Transkriptoms in der Modellpflanze Arabidopsis thaliana gewonnen werden. Mit dieser Analyse wird erstmals ein kompletter Datensatz über die Termin aller Primär- und Sekundärtranskripte und über die 3'-Enden inklusive nicht-kodierter Nukleotide in einer Pflanzenspezies erhoben. Dies ist einerseits eine essenzielle Grundlage für die Identifizierung von cis-Elementen im pflanzenmitochondrialen RNA-Metabolismus. Andererseits dient die umfassende Charakterisierung des Transkriptoms in erster Linie als Basis für die funktionelle Analyse trans-agierender Faktoren der RNA-Prozessierung. Aus Vergleichen des Transkriptoms aus Wildtyp und Mutanten bzw. RNAi-Linien, in denen die Expression potenziell an der mitochondrialen RNA-Prozessierung beteiligter Proteine unterdrückt wird, sollen Rückschlüsse über deren Funktion liefern. Primär und exemplarisch sollen zwei putative RNA-Helikasen und zwei Exoribonukleasen untersucht werden, deren mitochondriale Lokalisation eindeutig geklärt ist. Dieses Projekt zielt damit über die bloße, aber notwendige Datenerhebung hinaus und hält die funktionelle Analyse im Fokus. Bemerkung der Geschäftsstelle: Es handelt sich bei diesem Antrag um die überarbeitete Version eines am 30.10.2001 abgelehnten Antrags.

• DFG Programme: Research Grants