Untersuchungen zu molekularen Mechanismen der Transfer RNA-Gen-gerichteten Integration des Retrotransposons TRE5-A im Genom von Dictyostelium discoideum

• Applicant: Professor Dr. Thomas Winckler
• Subject Area: Pharmacy
• Term: from 2002 to 2011
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5386061

In dem hier beschriebenen wissenschaftlichen Vorhaben sollen verschiedene Aspekte der positionsspezifischen Integration bestimmter Retrotransposons vor tRNA-Genen im Genom von Dictyostelium discoideum untersucht werden. Grundlage der geplanten Arbeiten ist ein kürzlich etablierter in vivo-Test, der die gerichtete Integration in D. discoideum-Zellen aktiver Retrotransposons vor ein definiertes Ziel-tRNA-Gen darzustellen vermag. De novo-Integrationsereignisse können auf die Identität und Struktur der inserierten Elemente sowie auf kritische Insertionsparameter wie die Orientierung und den Abstand zum Ziel-tRNA-Gen hin untersucht werden. In weiterführenden Arbeiten soll definiert werden, welche DNA-Sequenzen des untersuchten Retrotransposons TRE5-A für die gerichtete Integration minimal benötigt werden. Hierzu werden Mini-TRE5-A-Elemente konstruiert und auf ihre Mobilität getestet. Außerdem soll versucht werden, durch Zufallsmutagenese des D. discoideum-Genoms Wirtsfaktoren zu identifizieren, die für die Retrotransposition des mobilen Elementes gebraucht werden.

• DFG Programme: Research Grants