Charakterisierung von Zielgenen des MADS-Box Gens DEFICIENS aus Antirrhinum majus mittels Makroarray- und Chromatin-Immunopräzipitations-Analysen

• Applicant: Professorin Dr. Sabine Zachgo
• Subject Area: Plant Cell and Developmental Biology
• Term: from 2003 to 2005
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5403189

In den letzten Jahren wurde in Modelorganismen wie Antirrhinum majus, Arabidopsis thaliana und Petunia hybrida intensiv die Funktion von homöotischen MADS-Box Genen untersucht, die die Blütenoranogenese steuern. Es ist aber immer noch ungeklärt, welche Zielgene das regulatorische Potential dieser Transkriptionsfaktoren in den einzelnen Blütenwirteln realisieren. Das Modellsystem Antirrhinum bietet optimale Voraussetzungen, um die Fragestellung zu untersuchen. Es stehen Makroarrays mit mehr als 11.000 verschiedenen cDNA Klonen und eine konditionelle Mutante des MADS-Box Gens DEFICIENS für 'expressions-profiling' Analysen zur Verfügung. Die Größe der Antirrhinum Blüte ermöglicht, diese Untersuchungen Stadien- und Organ-spezifisch durchzuführen. Über einen Vergleich zwischen dem Sepalen- und Petalentraskriptom sollen Petalen-spezifische Gene identifiziert werden, aus denen mittels konditioneller Mutanten direkte und indirekte Zielgene ermittelt werden. Ob ausgewählte Zielgene unter einer direkten oder indirekten Kontrolle von DEF stehen, soll mit einer etablierten Chromatin-Immunopräzipitations Methode geklärt werden, die es ermöglicht, eine in vivo Bindung der Proteine an genomische DNA-Fragmente nachzuweisen.

• DFG Programme: Research Grants